|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c1p53A_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: intercellular adhesion molecule-1; | PDBTitle: the crystal structure of icam-1 d3-d5 fragment |
Added to library: Tue Mar 16 12:38:22 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | F | V | L | P | A | T | P | P | Q | L | V | S | P | R | V | L | E | V | D | T | Q | G | T | V | V | C | S | L | D | G | L | F | P | V | S | E | A | Q | V | H | L | A | L | G | D | Q | R | L | N | P | T | V | T | Y | G | N | D | S | F | S | A | K | A | S | V | S | V | T | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | S | S | B | T | G | G | G | T | T | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | E | G | T | Q | R | L | T | C | A | V | I | L | G | N | Q | S | Q | E | T | L | Q | T | V | T | I | Y | S | F | P | A | P | N | V | I | L | T | K | P | E | V | S | E | G | T | E | V | T | V | K | C | E | A | G | P | R | A | Q | L | L | L | K | A | T | P | E | D | N | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | F | S | C | S | A | T | L | E | V | A | G | Q | L | I | H | K | N | Q | T | R | E | L | R | V | L | Y | G | P | R | L | D | E | R | D | C | P | G | N | W | T | W | P | E | N | S | Q | Q | T | P | M | C | Q | A | W | G | N | P | L | P | E | L | K | C | L | K | D | G | T | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | ||||||||||||||||
Sequence | P | L | P | I | G | E | S | V | T | V | T | R | D | L | E | G | T | Y | L | C | R | A | R | S | T | Q | G | E | V | T | R | E | V | T | V | N | V | L | S | P | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|