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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1oxjA_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: rna-binding protein smaug; | PDBTitle: crystal structure of the smaug rna binding domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:43:44 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | M | V | G | M | S | G | I | G | L | W | L | K | S | L | R | L | H | K | Y | I | E | L | F | K | N | M | T | Y | E | E | M | L | L | I | T | E | D | F | L | Q | S | V | G | V | T | K | G | A | S | H | K | L | A | L | C | I | D | K | L | K | E | R | A | N | I | L | N | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | Q | E | L | L | S | G | Q | M | E | L | S | T | A | V | E | E | L | T | N | I | V | L | T | P | M | K | P | L | E | S | P | G | P | P | E | E | N | I | G | L | R | F | L | K | V | I | D | I | V | T | N | T | L | Q | Q | D | P | Y | A | V | Q | D | D | E | T | L | G | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | |||||||||||||||||||
Sequence | M | W | I | L | D | R | S | I | H | N | E | A | F | M | N | H | A | S | Q | L | K | D | L | K | F | K | L | S | K | M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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