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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1ollA_ | PDB header: immune system/receptor | Chain: A: PDB Molecule: nk receptor; | PDBTitle: extracellular region of the human receptor nkp46 |
Added to library: Tue Mar 16 12:31:01 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | P | K | P | F | I | W | A | E | P | H | F | M | V | P | K | E | K | Q | V | T | I | C | C | Q | G | N | Y | G | A | V | E | Y | Q | L | H | F | E | G | S | L | F | A | V | D | R | P | K | P | P | E | R | I | N | K | V | K | F | Y | I | P | D | M | N | S | R | M | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | Y | S | C | I | Y | R | V | G | E | L | W | S | E | P | S | N | L | L | D | L | V | V | T | E | M | Y | D | T | P | T | L | S | V | H | P | G | P | E | V | I | S | G | E | K | V | T | F | Y | C | R | L | D | T | A | T | S | M | F | L | L | L | K | E | G | R | S | S | H | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||
Sequence | Q | R | G | Y | G | K | V | Q | A | E | F | P | L | G | P | V | T | T | A | H | R | G | T | Y | R | C | F | G | S | Y | N | N | H | A | W | S | F | P | S | E | P | V | K | L | L | V | T | G | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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