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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1o0vA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: immunoglobulin heavy chain epsilon-1; | PDBTitle: the crystal structure of ige fc reveals an asymmetrically2 bent conformation |
Added to library: Tue Mar 16 13:43:00 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | F | T | P | P | T | V | K | I | L | Q | S | S | C | D | G | G | G | H | F | P | P | T | I | Q | L | L | C | L | V | S | G | Y | T | P | G | T | I | Q | I | T | W | L | E | D | G | Q | V | M | D | V | D | L | S | T | A | S | T | T | Q | E | G | E | L | A | S | T | Q | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | L | S | Q | K | H | W | L | S | D | R | T | Y | T | C | Q | V | T | Y | Q | G | H | T | F | E | D | S | T | K | K | C | A | D | S | N | P | R | G | V | S | A | Y | L | S | R | P | S | P | F | D | L | F | I | R | K | S | P | T | I | T | C | L | V | V | D | L | A | P | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | G | T | V | Q | L | T | W | S | R | A | S | G | K | P | V | N | H | S | T | R | K | E | E | K | Q | R | N | G | T | L | T | V | T | S | T | L | P | V | G | T | R | D | W | I | E | G | E | T | Y | Q | C | R | V | T | H | P | H | L | P | R | A | L | M | R | S | T | T | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | G | P | R | A | A | P | E | V | Y | A | F | A | T | P | E | W | P | G | S | R | D | K | R | T | L | A | C | L | I | Q | N | F | M | P | E | D | I | S | V | Q | W | L | H | N | E | V | Q | L | P | D | A | R | H | S | T | T | Q | P | R | K | T | K | G | S | G | F | F | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | B | T | T | B | S | B | S | S | T | T | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | S | R | L | E | V | T | R | A | E | W | E | Q | K | D | E | F | I | C | R | A | V | H | E | A | A | S | P | S | Q | T | V | Q | R | A | V | S | V | N | P | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S |
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