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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1ntyA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: triple functional domain protein; | PDBTitle: crystal structure of the first dh/ph domain of trio to 1.7 a |
Added to library: Tue Mar 16 13:53:09 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | R | R | K | E | F | I | M | A | E | L | I | Q | T | E | K | A | Y | V | R | D | L | R | E | C | M | D | T | Y | L | W | E | M | T | S | G | V | E | E | I | P | P | G | I | V | N | K | E | L | I | I | F | G | N | M | Q | E | I | Y | E | F | H | N | N | I | F | L | K | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | K | Y | E | Q | L | P | E | D | V | G | H | C | F | V | T | W | A | D | K | F | Q | M | Y | V | T | Y | C | K | N | K | P | D | S | T | Q | L | I | L | E | H | A | G | S | Y | F | D | E | I | Q | Q | R | H | G | L | A | N | S | I | S | S | Y | L | I | K | P | V | Q | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | K | Y | Q | L | L | L | K | E | L | L | T | C | C | E | E | G | K | G | E | I | K | D | G | L | E | V | M | L | S | V | P | K | R | A | N | D | A | M | H | L | S | M | L | E | G | F | D | E | N | I | E | S | Q | G | E | L | I | L | Q | E | S | F | Q | V | W | D | P | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | I | R | K | G | R | E | R | H | L | F | L | F | E | M | S | L | V | F | S | K | E | V | K | D | S | S | G | R | S | K | Y | L | Y | K | S | K | L | F | T | S | E | L | G | V | T | E | H | V | E | G | D | P | C | K | F | A | L | W | V | G | R | T | P | T | S | D | N | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | L | K | A | S | S | I | E | N | K | Q | D | W | I | K | H | I | R | E | V | I | Q | E | R | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T |
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