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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1mv3A_ | PDB header: endocytosis/exocytosis | Chain: A: PDB Molecule: myc box dependent interacting protein 1; | PDBTitle: nmr structure of the tumor suppressor bin1: alternative2 splicing in melanoma and interaction with c-myc |
Added to library: Tue Mar 16 13:13:16 2010 | |
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Sequence | D | G | S | P | A | A | T | P | E | I | R | V | N | H | E | P | E | P | A | G | G | A | T | P | G | A | T | L | P | K | S | P | S | Q | L | R | K | G | P | P | V | P | P | P | P | K | H | T | P | S | K | E | V | K | Q | E | Q | I | L | S | L | F | E | D | T | F | V | P | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | V | T | T | P | S | Q | P | A | E | A | S | E | V | A | G | G | T | Q | P | A | A | G | A | Q | E | P | G | E | T | A | A | S | E | A | A | S | S | S | L | P | A | V | V | V | E | T | F | P | A | T | V | N | G | T | V | E | G | G | S | G | A | G | R | L | D | L | P | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | M | F | K | V | Q | A | Q | H | D | Y | T | A | T | D | T | D | E | L | Q | L | K | A | G | D | V | V | L | V | I | P | F | Q | N | P | E | E | Q | D | E | G | W | L | M | G | V | K | E | S | D | W | N | Q | H | K | K | L | E | K | C | R | G | V | F | P | E | N | F | T | E |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | B | S | T | T | B | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | G | G | G | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | G | G | G | G | G | G | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | T | T | ![]() | ![]() |   | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | R | V | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | ![]() | ![]() |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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