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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1mj1A_ | PDB header: ribosome | Chain: A: PDB Molecule: elongation factor tu; | PDBTitle: fitting the ternary complex of ef-tu/trna/gtp and ribosomal2 proteins into a 13 a cryo-em map of the coli 70s ribosome |
Added to library: Tue Mar 16 13:22:51 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | K | G | E | F | I | R | T | K | R | H | V | N | V | G | T | I | G | H | V | D | H | G | K | T | T | L | T | A | A | L | T | Y | V | A | A | A | E | N | R | N | V | E | V | K | D | Y | G | D | I | D | K | A | R | E | E | R | A | R | G | I | T | I | N | T | A | H | V | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | T | A | K | R | H | Y | S | H | V | D | C | R | G | H | A | D | Y | I | K | N | M | I | T | G | A | A | Q | M | D | G | A | I | L | V | V | S | A | A | D | G | R | M | R | Q | T | R | E | H | I | L | L | A | R | Q | V | G | V | R | Y | I | V | V | F | M | N | K | V | D | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | D | D | R | E | L | L | D | L | V | E | M | E | V | R | D | L | L | N | Q | Y | E | F | R | G | D | E | V | R | V | I | R | G | S | A | L | L | A | L | E | E | M | H | K | N | R | K | T | K | R | G | E | N | E | W | V | D | K | I | W | E | L | L | D | A | I | D | E | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | T | R | V | R | D | V | D | K | R | F | L | M | R | V | E | D | V | F | T | I | T | G | R | G | T | V | A | T | G | R | I | E | R | G | K | V | K | V | G | D | E | V | E | I | V | G | L | A | R | E | T | R | K | T | V | V | T | G | V | E | M | H | R | K | T | L | Q | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | I | A | G | D | N | V | G | L | L | L | R | G | V | S | R | E | E | V | E | R | G | Q | V | L | A | K | R | G | S | I | T | R | H | T | K | F | E | A | S | V | Y | I | L | K | K | E | E | G | G | R | H | T | G | F | F | T | G | Y | R | R | Q | F | Y | F | R | T | T | D | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | S | S | B | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . |
Sequence | G | V | V | R | L | R | Q | G | V | E | M | V | M | R | G | D | N | V | T | F | T | V | E | L | I | K | R | V | A | L | E | E | G | L | R | F | A | I | R | E | G | G | R | T | V | G | A | G | V | V | T | K | I | L | E | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T | T | T |
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