|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c1mhmA_ | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: s-adenosylmethionine decarboxylase; | PDBTitle: crystal structure of s-adenosylmethionine decarboxylase2 from potato |
Added to library: Tue Mar 16 14:12:25 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | L | F | V | Y | S | Y | K | I | I | I | K | T | C | G | T | T | K | L | L | L | A | I | P | P | I | L | R | L | A | E | T | L | S | L | K | V | Q | D | V | R | Y | T | R | G | S | R | H | F | S | E | E | V | A | V | L | D | G | Y | F | G | K | L | A | A | G | S | K | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | M | G | S | P | D | K | T | Q | K | W | H | V | Y | S | A | S | A | G | S | V | Q | S | N | D | P | V | Y | T | L | E | M | C | M | T | G | L | D | R | E | K | A | S | V | F | Y | K | T | E | E | S | S | A | A | H | M | T | V | R | S | G | I | R | K | I | L | P | K | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | G | G | G | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | C | D | F | E | F | E | P | C | G | Y | S | M | N | S | I | E | G | A | A | V | S | T | I | H | I | T | P | E | D | G | F | T | Y | A | S | F | E | S | V | G | Y | N | P | K | T | M | E | L | G | P | L | V | E | R | V | L | A | C | F | E | P | A | E | F | S | V | A | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | A | D | V | A | T | K | L | L | E | R | I | C | S | V | D | V | K | G | Y | S | L | A | E | W | S | P | E | E | F | G | E | G | G | S | I | V | Y | Q | K | F | T | R | T | |||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|