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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1mhcA_ | PDB header: histocompatibility antigen/peptide | Chain: A: PDB Molecule: mhc class i antigen h2-m3; | PDBTitle: model of mhc class i h2-m3 with nonapeptide from rat nd12 refined at 2.3 angstroms resolution |
Added to library: Tue Mar 16 13:36:19 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | H | S | L | R | Y | F | H | T | A | V | S | R | P | G | R | G | E | P | Q | Y | I | S | V | G | Y | V | D | D | V | Q | F | Q | R | C | D | S | I | E | E | I | P | R | M | E | P | R | A | P | W | M | E | K | E | R | P | E | Y | W | K | E | L | K | L | K | V | K | N | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | Q | S | A | R | A | N | L | R | T | L | L | R | Y | Y | N | Q | S | E | G | G | S | H | I | L | Q | W | M | V | S | C | E | V | G | P | D | M | R | L | L | G | A | H | Y | Q | A | A | Y | D | G | S | D | Y | I | T | L | N | E | D | L | S | S | W | T | A | V | D | M | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | I | T | K | S | R | L | E | S | A | G | T | A | E | Y | F | R | A | Y | V | E | G | E | C | L | E | L | L | H | R | F | L | R | N | G | K | E | I | L | Q | R | A | D | P | P | K | A | H | V | A | H | H | P | R | P | K | G | D | V | T | L | R | C | W | A | L | G | F | Y | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | D | I | T | L | T | W | Q | K | D | E | E | D | L | T | Q | D | M | E | L | V | E | T | R | P | S | G | D | G | T | F | Q | K | W | A | A | V | V | V | P | S | G | E | E | Q | R | Y | T | C | Y | V | H | H | E | G | L | T | E | P | L | A | L | K | W | R | S | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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