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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1lwuH_ | PDB header: blood clotting | Chain: H: PDB Molecule: fibrinogen beta chain; | PDBTitle: crystal structure of fragment d from lamprey fibrinogen2 complexed with the peptide gly-his-arg-pro-amide |
Added to library: Tue Mar 16 13:21:38 2010 | |
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Sequence | A | Q | K | E | I | E | N | R | Y | K | E | V | K | I | R | I | E | S | T | V | A | G | S | L | R | S | M | K | S | V | L | E | H | L | R | A | K | M | Q | R | M | E | E | A | I | K | T | Q | K | E | L | C | S | A | P | C | T | V | N | C | R | V | P | V | V | S | G | M | H | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | D | I | Y | R | N | G | G | R | T | S | E | A | Y | Y | I | Q | P | D | L | F | S | E | P | Y | K | V | F | C | D | M | E | S | H | G | G | G | W | T | V | V | Q | N | R | V | D | G | S | S | N | F | A | R | D | W | N | T | Y | K | A | E | F | G | N | I | A | F | G | N | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | S | I | C | N | I | P | G | E | Y | W | L | G | T | K | T | V | H | Q | L | T | K | Q | H | T | Q | Q | V | L | F | D | M | S | D | W | E | G | S | S | V | Y | A | Q | Y | A | S | F | R | P | E | N | E | A | Q | G | Y | R | L | W | V | E | D | Y | S | G | N | A | G | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | L | E | G | A | T | Q | L | M | G | D | N | R | T | M | T | I | H | N | G | M | Q | F | S | T | F | D | R | D | N | D | N | W | N | P | G | D | P | T | K | H | C | S | R | E | D | A | G | G | W | W | Y | N | R | C | H | A | A | N | P | N | G | R | Y | Y | W | G | G | I | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | B | B | T | T | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . |
Sequence | T | K | E | Q | A | D | Y | G | T | D | D | G | V | V | W | M | N | W | K | G | S | W | Y | S | M | R | Q | M | A | M | K | L | R | P | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | B | S |
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