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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1l6zA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: biliary glycoprotein c; | PDBTitle: crystal structure of murine ceacam1a[1,4]: a coronavirus2 receptor and cell adhesion molecule in the cea family |
Added to library: Tue Mar 16 12:26:12 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | T | I | E | A | V | P | P | Q | V | A | E | D | N | N | V | L | L | L | V | H | N | L | P | L | A | L | G | A | F | A | W | Y | K | G | N | T | T | A | I | D | K | E | I | A | R | F | V | P | N | S | N | M | N | F | T | G | Q | A | Y | S | G | R | E | I | I | Y | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | S | L | L | F | Q | M | I | T | M | K | D | M | G | V | Y | T | L | D | M | T | D | E | N | Y | R | R | T | Q | A | T | V | R | F | H | V | H | Q | P | V | T | Q | P | F | L | Q | V | T | N | T | T | V | K | E | L | D | S | V | T | L | T | C | L | S | N | D | I | G | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | I | Q | W | L | F | N | S | Q | S | L | Q | L | T | E | R | M | T | L | S | Q | N | N | S | I | L | R | I | D | P | I | K | R | E | D | A | G | E | Y | Q | C | E | I | S | N | P | V | S | V | R | R | S | N | S | I | K | L | D | I | I | F | D | P | S | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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