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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1kzyD_ | PDB header: dna binding protein, protein binding | Chain: D: PDB Molecule: tumor suppressor p53-binding protein 1; | PDBTitle: crystal structure of the 53bp1 brct region complexed to2 tumor suppressor p53 |
Added to library: Tue Mar 16 13:15:33 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | L | E | E | Q | R | G | P | L | P | L | N | K | T | L | F | L | G | Y | A | F | L | L | T | M | A | T | I | P | P | F | N | K | Q | Y | T | E | S | Q | L | R | A | G | A | G | Y | I | L | E | D | F | N | E | A | Q | C | N | T | A | Y | Q | C | L | L | I | A | D | Q | H | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | T | R | K | Y | F | L | C | L | A | S | G | I | P | C | V | S | H | V | W | V | H | D | S | C | H | A | N | Q | L | Q | N | Y | R | N | Y | L | L | P | A | G | Y | S | L | E | E | Q | R | I | L | D | W | Q | P | R | E | N | P | F | Q | N | L | K | V | L | L | V | S | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | S | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | Q | N | F | L | E | L | W | S | E | I | L | M | T | G | G | A | A | S | V | K | Q | H | H | S | S | A | H | N | K | D | I | A | L | G | V | F | D | V | V | V | T | D | P | S | C | P | A | S | V | L | K | C | A | E | A | L | Q | L | P | V | V | S | Q | E | W | V | I | Q | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | I | V | G | E | R | I | G | F | K | Q | H | P | K | Y | K | H | D | Y | V | S | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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