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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1kqsA_ | PDB header: ribosome | Chain: A: PDB Molecule: ribosomal protein l2; | PDBTitle: the haloarcula marismortui 50s complexed with a2 pretranslocational intermediate in protein synthesis |
Added to library: Tue Mar 16 12:14:09 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | R | R | I | Q | G | Q | R | R | G | R | G | T | S | T | F | R | A | P | S | H | R | Y | K | A | D | L | E | H | R | K | V | E | D | G | D | V | I | A | G | T | V | V | D | I | E | H | D | P | A | R | S | A | P | V | A | A | V | E | F | E | D | G | D | R | R | L | I | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | E | G | V | G | V | G | D | E | L | Q | V | G | V | D | A | E | I | A | P | G | N | T | L | P | L | A | E | I | P | E | G | V | P | V | C | N | V | E | S | S | P | G | D | G | G | K | F | A | R | A | S | G | V | N | A | Q | L | L | T | H | D | R | N | V | A | V | V | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | B | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S | B | S | S | T | T | S | B | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | S | G | E | M | K | R | L | D | P | Q | C | R | A | T | I | G | V | V | G | G | G | G | R | T | D | K | P | F | V | K | A | G | N | K | H | H | K | M | K | A | R | G | T | K | W | P | N | V | R | G | V | A | M | N | A | V | D | H | P | F | G | G | G | G | R | Q | H | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | B | S | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | K | P | K | S | I | S | R | N | A | P | P | G | R | K | V | G | D | I | A | S | K | R | T | G | R | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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