|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c1keeH_ | PDB header: ligase | Chain: H: PDB Molecule: carbamoyl-phosphate synthetase small chain; | PDBTitle: inactivation of the amidotransferase activity of carbamoyl2 phosphate synthetase by the antibiotic acivicin |
Added to library: Tue Mar 16 13:21:56 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | I | K | S | A | L | L | V | L | E | D | G | T | Q | F | H | G | R | A | I | G | A | T | G | S | A | V | G | E | V | V | F | N | T | S | M | T | G | Y | Q | E | I | L | T | D | P | S | Y | S | R | Q | I | V | T | L | T | Y | P | H | I | G | N | V | G | T | N | D | A | D | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | G | G | G | B | T | S | S | S | B | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | S | Q | V | H | A | Q | G | L | V | I | R | D | L | P | L | I | A | S | N | F | R | N | T | E | D | L | S | S | Y | L | K | R | H | N | I | V | A | I | A | D | I | D | T | R | K | L | T | R | L | L | R | E | K | G | A | Q | N | G | C | I | I | A | G | D | N | P | D | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | S | B | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | L | E | K | A | R | A | F | P | G | L | N | G | M | D | L | A | K | E | V | T | T | A | E | A | Y | S | W | T | Q | G | S | W | T | L | T | G | G | L | P | E | A | K | K | E | D | E | L | P | F | H | V | V | A | Y | D | F | G | A | K | R | N | I | L | R | M | L | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | S | S | S | B | T | T | T | B | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | G | C | R | L | T | I | V | P | A | Q | T | S | A | E | D | V | L | K | M | N | P | D | G | I | F | L | S | N | G | P | G | D | P | A | P | C | D | Y | A | I | T | A | I | Q | K | F | L | E | T | D | I | P | V | F | G | I | L | G | H | Q | L | L | A | L | A | S | G | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | B | S | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | T | V | K | M | K | F | G | H | H | G | G | N | H | P | V | K | D | V | E | K | N | V | V | M | I | T | A | Q | N | H | G | F | A | V | D | E | A | T | L | P | A | N | L | R | V | T | H | K | S | L | F | D | G | T | L | Q | G | I | H | R | T | D | K | P | A | F | S | F | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | H | P | E | A | S | P | G | P | H | D | A | A | P | L | F | D | H | F | I | E | L | I | E | Q | Y | R | K | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|