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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1k8iB_ | PDB header: immune system | Chain: B: PDB Molecule: mhc class ii h2-m beta 2 chain; | PDBTitle: crystal structure of mouse h2-dm |
Added to library: Tue Mar 16 13:36:13 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | F | V | A | H | V | E | S | T | C | V | L | N | D | A | G | T | P | Q | D | F | T | Y | C | V | S | F | N | K | D | L | L | A | C | W | D | P | D | V | G | K | I | V | P | C | E | F | G | V | L | S | R | L | A | E | I | I | S | N | I | L | N | E | Q | E | S | L | I | H | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | Q | N | G | L | Q | D | C | A | T | H | T | Q | P | F | W | D | V | L | T | H | R | T | R | A | P | S | V | R | V | A | Q | T | T | P | F | N | T | R | E | P | V | M | L | A | C | Y | V | W | G | F | Y | P | A | D | V | T | I | T | W | M | K | N | G | Q | L | V | P | S | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | B | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | |||||||
Sequence | S | N | K | E | K | T | A | Q | P | N | G | D | W | T | Y | Q | T | V | S | Y | L | A | L | T | P | S | Y | G | D | V | Y | T | C | V | V | Q | H | S | G | T | S | E | P | I | R | G | D | W | T | P | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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