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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1jn5B_ | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: tap; | PDBTitle: structural basis for the recognition of a nucleoporin fg-2 repeat by the ntf2-like domain of tap-p15 mrna export3 factor |
Added to library: Tue Mar 16 14:28:07 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | P | P | C | K | G | S | Y | F | G | T | E | N | L | K | S | L | V | L | H | F | L | Q | Q | Y | Y | A | I | Y | D | S | G | D | R | Q | G | L | L | D | A | Y | H | D | G | A | C | C | S | L | S | I | P | F | I | A | R | S | S | L | A | E | Y | F | K | D | S | R | N | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | S | S | G | G | G | G | G | G | T | S | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | K | D | P | T | L | R | F | R | L | L | K | H | T | R | L | N | V | V | A | F | L | N | E | L | P | K | T | Q | H | D | V | N | S | F | V | V | D | I | S | A | Q | T | S | T | L | L | C | F | S | V | N | G | V | F | K | E | V | D | G | K | S | R | D | S | L | R | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | |||||||||
Sequence | T | R | T | F | I | A | V | P | A | S | N | S | G | L | C | I | V | N | D | E | L | F | V | R | N | A | S | S | E | E | I | Q | R | A | F | A | M | P | A | P | T | P | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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