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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1je6A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: mhc class i chain-related protein; | PDBTitle: structure of the mhc class i homolog micb |
Added to library: Tue Mar 16 13:07:58 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | P | H | S | L | R | Y | N | L | M | V | L | S | Q | D | G | S | V | Q | S | G | F | L | A | E | G | H | L | D | G | Q | P | F | L | R | Y | D | R | Q | K | R | R | A | K | P | Q | G | Q | W | A | E | D | V | L | G | A | E | T | W | D | T | E | T | E | D | L | T | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | Q | D | L | R | R | T | L | T | H | I | K | D | Q | K | G | G | L | H | S | L | Q | E | I | R | V | C | E | I | H | E | D | S | S | T | R | G | S | R | H | F | Y | Y | N | G | E | L | F | L | S | Q | N | L | E | T | Q | E | S | T | V | P | Q | S | S | R | A | Q | T | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | N | V | T | N | F | W | K | E | D | A | M | K | T | K | T | H | Y | R | A | M | Q | A | D | C | L | Q | K | L | Q | R | Y | L | K | S | G | V | A | I | R | R | T | V | P | P | M | V | N | V | T | C | S | E | V | S | E | G | N | I | T | V | T | C | R | A | S | S | F | Y | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | B | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . |
Sequence | R | N | I | T | L | T | W | R | Q | D | G | V | S | L | S | H | N | T | Q | Q | W | G | D | V | L | P | D | G | N | G | T | Y | Q | T | W | V | A | T | R | I | R | Q | G | E | E | Q | R | F | T | C | Y | M | E | H | S | G | N | H | G | T | H | P | V | P | S | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | B | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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