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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1iebD_ | PDB header: histocompatibility antigen | Chain: D: PDB Molecule: mhc class ii i-ek; | PDBTitle: histocompatibility antigen |
Added to library: Tue Mar 16 13:34:17 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | D | R | M | V | N | H | F | I | A | E | F | K | R | K | G | G | S | L | V | P | R | G | S | G | G | G | G | S | R | P | W | F | L | E | Y | C | K | S | E | C | H | F | Y | N | G | T | Q | R | V | R | L | L | V | R | Y | F | Y | N | L | E | E | N | L | R | F | D | S | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | E | F | R | A | V | T | E | L | G | R | P | D | A | E | N | W | N | S | Q | P | E | F | L | E | Q | K | R | A | E | V | D | T | V | C | R | H | N | Y | E | I | F | D | N | F | L | V | P | R | R | V | E | P | T | V | T | V | Y | P | T | K | T | Q | P | L | E | H | H | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | V | C | S | V | S | D | F | Y | P | G | N | I | E | V | R | W | F | R | N | G | K | E | E | K | T | G | I | V | S | T | G | L | V | R | N | G | D | W | T | F | Q | T | L | V | M | L | E | T | V | P | Q | S | G | E | V | Y | T | C | Q | V | E | H | P | S | L | T | D | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | V | E | W | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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