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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1gz0H_ | PDB header: transferase | Chain: H: PDB Molecule: hypothetical trna/rrna methyltransferase yjfh; | PDBTitle: 23s ribosomal rna g2251 2'o-methyltransferase rlmb |
Added to library: Wed Jan 9 18:46:01 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | V | P | R | G | S | H | X | S | E | X | I | Y | G | I | H | A | V | Q | A | L | L | E | R | A | P | E | R | F | Q | E | V | F | I | L | K | G | R | E | D | K | R | L | L | P | L | I | H | A | L | E | S | Q | G | V | V | I | Q | L | A | N | R | Q | Y | L | D | E | K | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | A | V | H | Q | G | I | I | A | R | V | K | P | G | R | Q | Y | Q | E | N | D | L | P | D | L | I | A | S | L | D | Q | P | F | L | L | I | L | D | G | V | T | D | P | H | N | L | G | A | C | L | R | S | A | D | A | A | G | V | H | A | V | I | V | P | K | D | R | S | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | G | G | G | S | S | S | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | N | A | T | A | K | K | V | A | C | G | A | A | E | S | V | P | L | I | R | V | T | N | L | A | R | T | X | R | X | L | Q | E | E | N | I | W | I | V | G | T | A | G | E | A | D | H | T | L | Y | Q | S | K | X | T | G | R | L | A | L | V | X | G | A | E | G | E | G | X | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | T | S | S | T | T | T | T | S | S | B | G | G | G | S | S | S | B | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | |
Sequence | R | L | T | R | E | H | C | D | E | L | I | S | I | P | X | A | G | S | V | S | S | L | N | V | S | V | A | T | G | I | C | L | F | E | A | V | R | Q | R | S | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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