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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1gqpB_ | PDB header: cell cycle | Chain: B: PDB Molecule: doc1/apc10; | PDBTitle: apc10/doc1 subunit of s. cerevisiae |
Added to library: Tue Mar 16 12:19:58 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | V | L | V | L | D | D | R | T | K | D | L | Y | V | N | G | F | Q | E | I | Q | Y | Q | N | P | T | P | E | N | L | Q | H | M | F | H | Q | G | I | E | I | L | D | S | A | R | M | I | N | V | T | H | L | A | L | W | K | P | S | S | F | K | L | G | N | P | V | D | F | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | G | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | D | N | Y | D | T | F | W | Q | S | D | G | G | Q | P | H | Q | L | D | I | M | F | S | K | R | M | D | I | C | V | M | A | I | F | F | S | M | I | A | D | E | S | Y | A | P | S | L | V | K | V | Y | A | G | H | S | P | S | D | A | R | F | Y | K | M | L | E | V | R | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||
Sequence | N | G | W | V | A | L | R | F | L | D | N | R | E | D | D | Q | L | L | K | C | Q | F | I | R | L | L | F | P | V | N | H | E | N | G | K | D | T | H | L | R | G | I | R | L | Y | V | P | S | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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