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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1g4wR_ | PDB header: signaling protein | Chain: R: PDB Molecule: protein tyrosine phosphatase sptp; | PDBTitle: crystal structure of the salmonella tyrosine phosphatase2 and gtpase activating protein sptp |
Added to library: Tue Mar 16 13:46:09 2010 | |
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Sequence | L | L | D | I | A | L | K | G | L | K | R | T | L | P | Q | L | E | Q | M | D | G | N | S | L | R | P | L | R | S | L | M | T | N | L | Q | N | L | N | K | Q | L | N | D | Y | V | T | T | L | T | N | I | Q | V | G | V | A | R | F | S | Q | W | E | V | E | R | W | V | D | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | H | E | L | T | Q | A | V | K | K | I | H | V | I | A | K | E | L | K | N | V | T | A | E | L | E | K | I | P | Q | T | M | S | G | P | T | L | G | L | A | R | F | A | V | S | S | I | P | I | N | Q | Q | T | Q | V | K | L | S | D | G | M | P | V | P | V | N | T | L | T | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | G | K | P | V | A | L | A | G | S | Y | P | K | N | T | P | D | A | L | E | A | H | M | K | M | L | L | E | K | E | C | S | C | L | V | V | L | T | S | E | D | Q | M | Q | A | K | Q | L | P | P | Y | F | R | G | S | Y | T | F | G | E | V | H | T | N | S | Q | K | V | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | S | Q | G | E | A | I | D | Q | Y | N | M | Q | L | S | C | G | E | K | R | Y | T | I | P | V | L | H | V | K | N | W | P | D | H | Q | P | L | P | S | T | D | Q | L | E | Y | L | A | D | R | V | K | N | S | N | Q | N | G | A | P | G | R | S | S | S | D | K | H | L | P | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . |
Sequence | I | H | C | L | G | G | V | G | R | T | G | T | M | A | A | A | L | V | L | K | D | N | P | H | S | N | L | E | Q | V | R | A | D | F | R | D | S | R | N | N | R | M | L | E | D | A | S | Q | F | V | Q | L | K | A | M | Q | A | Q | L | L | M | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T |
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