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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1fs2C_ | PDB header: ligase | Chain: C: PDB Molecule: skp2; | PDBTitle: insights into scf ubiquitin ligases from the structure of2 the skp1-skp2 complex |
Added to library: Wed Jan 9 19:15:26 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | G | V | S | W | D | S | L | P | D | E | L | L | L | G | I | F | S | C | L | C | L | P | E | L | L | K | V | S | G | V | C | K | R | W | Y | R | L | A | S | D | E | S | L | W | Q | T | L | D | E | F | R | V | Q | H | M | D | L | S | N | S | V | I | E | V | S | T | L | H | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | T | T | S | T | T | T | S | G | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | L | S | Q | C | S | K | L | Q | N | L | S | L | E | G | L | R | L | S | D | P | I | V | N | T | L | A | K | N | S | N | L | V | R | L | N | L | S | G | C | S | G | F | S | E | F | A | L | Q | T | L | L | S | S | C | S | R | L | D | E | L | N | L | S | W | C | F | D | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | B | T | T | T | T | T | T | B | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | K | H | V | Q | V | A | V | A | H | V | S | E | T | I | T | Q | L | N | L | S | G | Y | R | K | N | L | Q | K | S | D | L | S | T | L | V | R | R | C | P | N | L | V | H | L | D | L | S | D | S | V | M | L | K | N | D | C | F | Q | E | F | F | Q | L | N | Y | L | Q | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | L | S | R | C | Y | D | I | I | P | E | T | L | L | E | L | G | E | I | P | T | L | K | T | L | Q | V | F | G | I | V | P | D | G | T | L | Q | L | L | K | E | A | L | P | H | L | Q | I | N | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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