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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1foeA_ | PDB header: signaling protein, immune system/signali | Chain: A: PDB Molecule: t-lymphoma invasion and metastasis inducing | PDBTitle: crystal structure of rac1 in complex with the guanine2 nucleotide exchange region of tiam1 |
Added to library: Tue Mar 16 12:54:07 2010 | |
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Sequence | Q | L | S | D | A | D | K | L | R | K | V | I | C | E | L | L | E | T | E | R | T | Y | V | K | D | L | N | C | L | X | E | R | Y | L | K | P | L | Q | K | E | T | F | L | T | Q | D | E | L | D | V | L | F | G | N | L | T | E | X | V | E | F | Q | V | E | F | L | K | T | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | G | V | R | L | V | P | D | L | E | K | L | E | K | V | D | Q | F | K | K | V | L | F | S | L | G | G | S | F | L | Y | Y | A | D | R | F | K | L | Y | S | A | F | C | A | S | H | T | K | V | P | K | V | L | V | K | A | K | T | D | T | A | F | K | A | F | L | D | A | Q | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | G | G | G | G | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | R | Q | Q | H | S | S | T | L | E | S | Y | L | I | K | P | I | Q | R | V | L | K | Y | P | L | L | L | R | E | L | F | A | L | T | D | A | E | S | E | E | H | Y | H | L | D | V | A | I | K | T | X | N | K | V | A | S | H | I | N | E | X | Q | K | I | H | E | E | F | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | F | D | Q | L | I | A | E | Q | T | G | E | K | K | E | V | A | D | L | S | X | G | D | L | L | L | H | T | S | V | I | W | L | N | P | P | A | S | L | G | K | W | K | K | E | P | E | L | A | A | F | V | F | K | T | A | V | V | L | V | Y | K | D | G | S | K | Q | K | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | L | V | G | S | H | R | L | S | I | Y | E | E | W | D | P | F | R | F | R | H | X | I | P | T | E | A | L | Q | V | R | A | L | P | S | A | D | A | E | A | N | A | V | C | E | I | V | H | V | K | S | E | S | E | G | R | P | E | R | V | F | H | L | C | C | S | S | P | E | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | B | T | G | G | G | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | D | F | L | K | S | V | H | S | I | L | R | D | K | H | R | R | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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