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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1fnxH_ | PDB header: immune system/rna | Chain: H: PDB Molecule: hu antigen c; | PDBTitle: solution structure of the huc rbd1-rbd2 complexed with the2 au-rich element |
Added to library: Tue Mar 16 13:39:45 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | D | S | K | T | N | L | I | V | N | Y | L | P | Q | N | M | T | Q | D | E | F | K | S | L | F | G | S | I | G | D | I | E | S | C | K | L | V | R | D | K | I | T | G | Q | S | L | G | Y | G | F | V | N | Y | S | D | P | N | D | A | D | K | A | I | N | T | L | N | G | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | Q | T | K | T | I | K | V | S | Y | A | R | P | S | S | A | S | I | R | D | A | N | L | Y | V | S | G | L | P | K | T | M | S | Q | K | E | M | E | Q | L | F | S | Q | Y | G | R | I | I | T | S | R | I | L | L | D | Q | A | T | G | V | S | R | G | V | G | F | I | R | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | K | R | I | E | A | E | E | A | I | K | G | L | N | G | Q | K | P | L | G | A | A | E | P | I | T | V | K | F | A | N | N | P | S | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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