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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1deqD_ | PDB header: blood clotting | Chain: D: PDB Molecule: fibrinogen (alpha chain); | PDBTitle: the crystal structure of modified bovine fibrinogen (at ~42 angstrom resolution) |
Added to library: Tue Mar 16 12:13:31 2010 | |
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Sequence | N | T | K | C | P | S | G | C | R | M | K | G | L | I | D | E | V | D | Q | D | F | T | S | R | I | N | K | L | R | D | S | L | F | N | Y | Q | K | N | S | K | D | S | N | T | L | T | K | N | I | V | E | L | M | R | G | D | F | A | K | A | N | N | N | D | N | T | F | K | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | E | D | L | R | S | R | I | E | I | L | R | R | K | V | I | E | Q | V | Q | R | I | N | L | L | Q | K | N | V | R | D | Q | L | V | D | M | K | R | L | E | V | D | I | D | I | K | I | R | S | C | K | G | S | C | S | R | A | L | E | H | K | V | D | L | E | D | Y | K | N | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | K | Q | L | E | Q | V | I | A | I | N | L | L | P | S | R | D | I | Q | Y | L | P | I | L | K | M | S | T | I | T | G | P | V | P | R | E | F | K | S | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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