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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1dcqA_ | PDB header: metal binding protein | Chain: A: PDB Molecule: pyk2-associated protein beta; | PDBTitle: crystal structure of the arf-gap domain and ankyrin repeats2 of papbeta. |
Added to library: Tue Mar 16 13:14:01 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | T | K | E | I | I | S | E | V | Q | R | M | T | G | N | D | V | C | C | D | C | G | A | P | D | P | T | W | L | S | T | N | L | G | I | L | T | C | I | E | C | S | G | I | H | R | E | L | G | V | H | Y | S | R | M | Q | S | L | T | L | D | V | L | G | T | S | E | L | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | B | T | T | T | B | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | K | N | I | G | N | A | G | F | N | E | I | M | E | C | C | L | P | S | E | D | P | V | K | P | N | P | G | S | D | M | I | A | R | K | D | Y | I | T | A | K | Y | M | E | R | R | Y | A | R | K | K | H | A | D | T | A | A | K | L | H | S | L | C | E | A | V | K | T | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | F | G | L | L | Q | A | Y | A | D | G | V | D | L | T | E | K | I | P | L | A | N | G | H | E | P | D | E | T | A | L | H | L | A | V | R | S | V | D | R | T | S | L | H | I | V | D | F | L | V | Q | N | S | G | N | L | D | K | Q | T | G | K | G | S | T | A | L | H | Y | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | B | S | S | S | S | T | T | B | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | C | L | T | D | N | A | E | C | L | K | L | L | L | R | G | K | A | S | I | E | I | A | N | E | S | G | E | T | P | L | D | I | A | K | R | L | K | H | E | H | C | E | E | L | L | T | Q | A | L | S | G | R | F | N | S | H | V | H | V | E | Y | E | W | R | L | L | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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