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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1dbhA_ | PDB header: gene regulation | Chain: A: PDB Molecule: protein (human sos 1); | PDBTitle: dbl and pleckstrin homology domains from hsos1 |
Added to library: Tue Mar 16 12:02:32 2010 | |
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Sequence | E | Q | T | Y | Y | D | L | V | K | A | F | X | A | E | I | R | Q | Y | I | R | E | L | N | L | I | I | K | V | F | R | E | P | F | V | S | N | S | K | L | F | S | A | N | D | V | E | N | I | F | S | R | I | V | D | I | H | E | L | S | V | K | L | L | G | H | I | E | D | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | X | T | D | E | G | S | P | H | P | L | V | G | S | C | F | E | D | L | A | E | E | L | A | F | D | P | Y | E | S | Y | A | R | D | I | L | R | P | G | F | H | D | R | F | L | S | Q | L | S | K | P | G | A | A | L | Y | L | Q | S | I | G | E | G | F | K | E | A | V | Q | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | L | P | R | L | L | L | A | P | V | Y | H | C | L | H | Y | F | E | L | L | K | Q | L | E | E | K | S | E | D | Q | E | D | K | E | C | L | K | Q | A | I | T | A | L | L | N | V | Q | S | G | X | E | K | I | C | S | K | S | L | A | K | R | R | L | S | E | S | A | A | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | X | N | E | I | Q | K | N | I | D | G | W | E | G | K | D | I | G | Q | C | C | N | E | F | I | X | E | G | T | L | T | R | V | G | A | K | H | E | R | H | I | F | L | F | D | G | L | X | I | C | C | K | S | N | H | G | Q | P | R | L | P | G | A | S | N | A | E | Y | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 |
Sequence | K | E | K | F | F | X | R | K | V | Q | I | N | D | K | D | D | T | N | E | Y | K | H | A | F | E | I | I | L | K | D | E | N | S | V | I | F | S | A | K | S | A | E | E | K | N | N | W | X | A | A | L | I | S | L | Q | Y | R | S | T | L | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T |
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