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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1cunC_ | PDB header: structural protein | Chain: C: PDB Molecule: protein (alpha spectrin); | PDBTitle: crystal structure of repeats 16 and 17 of chicken brain2 alpha spectrin |
Added to library: Tue Mar 16 12:42:26 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | V | H | Q | F | F | R | D | M | D | D | E | E | S | W | I | K | E | K | K | L | L | V | S | S | E | D | Y | G | R | D | L | T | G | V | Q | N | L | R | K | K | H | K | R | L | E | A | E | L | A | A | H | E | P | A | I | Q | S | V | L | D | T | G | K | K | L | S | D | D | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | I | G | K | E | E | I | Q | Q | R | L | A | Q | F | V | D | H | W | K | E | L | K | Q | L | A | A | A | R | G | Q | R | L | E | E | S | L | E | Y | Q | Q | F | V | A | N | V | E | E | E | E | A | W | I | N | E | K | M | T | L | V | A | S | E | D | Y | G | D | T | L | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | Q | G | L | L | K | K | H | E | A | F | E | T | D | F | T | V | H | K | D | R | V | N | D | V | C | A | N | G | E | D | L | I | K | K | N | N | H | H | V | E | N | I | T | A | K | M | K | G | L | K | G | K | V | S | D | L | E | K | A | A | A | Q | R | K | A | K | L | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |   | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | S | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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