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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1bcpH_ | PDB header: toxin | Chain: H: PDB Molecule: pertussis toxin; | PDBTitle: binary complex of pertussis toxin and atp |
Added to library: Tue Mar 16 14:25:44 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | G | I | V | I | P | P | Q | E | Q | I | T | Q | H | G | S | P | Y | G | R | C | A | N | K | T | R | A | L | T | V | A | E | L | R | G | S | G | D | L | Q | E | Y | L | R | H | V | T | R | G | W | S | I | F | A | L | Y | D | G | T | Y | L | G | G | E | Y | G | G | V | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | S | S | B | S | T | T | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | G | T | P | G | G | A | F | D | L | K | T | T | F | C | I | M | T | T | R | N | T | G | Q | P | A | T | D | H | Y | Y | S | N | V | T | A | T | R | L | L | S | S | T | N | S | R | L | C | A | V | F | V | R | S | G | Q | P | V | I | G | A | C | T | S | P | Y | D | G | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | W | S | M | Y | S | R | L | R | K | M | L | Y | L | I | Y | V | A | G | I | S | V | R | V | H | V | S | K | E | E | Q | Y | Y | D | Y | E | D | A | T | F | E | T | Y | A | L | T | G | I | S | I | C | N | P | G | S | S | L | C | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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