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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1b5fC_ | PDB header: hydrolase | Chain: C: PDB Molecule: protein (cardosin a); | PDBTitle: native cardosin a from cynara cardunculus l. |
Added to library: Tue Mar 16 14:10:00 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | A | V | V | A | L | T | N | D | R | D | T | S | Y | F | G | E | I | G | I | G | T | P | P | Q | K | F | T | V | I | F | D | T | G | S | S | V | L | W | V | P | S | S | K | C | I | N | S | K | A | C | R | A | H | S | M | Y | E | S | S | D | S | S | T | Y | K | E | N | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | S | T | S | B | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | G | A | I | I | Y | G | T | G | S | I | T | G | F | F | S | Q | D | S | V | T | I | G | D | L | V | V | K | E | Q | D | F | I | E | A | T | D | E | A | D | N | V | F | L | H | R | L | F | D | G | I | L | G | L | S | F | Q | T | I | S | V | P | V | W | Y | N | M | L | N | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | L | V | K | E | R | R | F | S | F | W | L | N | R | N | V | D | E | E | E | G | G | E | L | V | F | G | G | L | D | P | N | H | F | R | G | D | H | T | Y | V | P | V | T | Y | Q | Y | Y | W | Q | F | G | I | G | D | V | L | I | G | D | K | S | T | G | F | C | A | P | G | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | S | T | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | Q | A | F | A | D | S | G | T | S | L | L | S | G | P | T | A | I | V | T | Q | I | N | H | A | I | G | A | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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