Job Description P52095 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 12:05:15 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 374 % Identity 15% Template d1kl1a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 1.93

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		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.									.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	L	D	N	I	T	P	P	F	T	K	A	L	F	T	Y	V	K	E	R	K	Y	T	F	C	T	P	G	H	M	G	G	T	A	Y	Q	K	S	P	V	G	C	L	F	Y	D	F	F	G	G	N	T	L	K	A	D	V	S	I	S	V	T	E	L	G	S	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	T
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.								.							.	.	.	.	.	.	.	.								.										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.								.							.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template Sequence		K	Y	L	P	Q	Q	D	P	Q	V	F	A	A	I	E	Q	E	R	K	R	Q	H	A	K	I	E	L	.	.	.	I	A	S	E	N	F	V	.	S	R	A	V	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	G	S	V	L	T	.	N	K	Y	A	E	G	Y	P	G	R	R	Y	Y	G	G	C	E	Y	V	D
Template Known Secondary structure																									S				.	.	.		T	T					.							.	.	.	.	.	.	.	.			T	S	G	G	G	.	G							T	T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.								.							.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.				.	30	.	.	.	.	.		.	.	.	.	40	.									.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.				.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.
Query Sequence		G	P	H	L	E	A	E	E	Y	I	A	R	T	F	G	A	E	Q	S	Y	I	V	T	N	G	T	S	T	S	N	K	I	V	G	M	Y	A	A	P	S	G	S	T	L	L	I	D	R	N	C	H	.	.	.	K	S	L	A	H	L	L	M	M	N	D	V	V	P	V	W	L	K	P	T	R	N	A	L	G	I
Query Conservation																																																					.	.	.
Alig confidence																																																					.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	V	E	E	L	A	R	E	R	A	K	Q	L	F	G	A	E	H	A	N	V	Q	P	H	S	G	A	Q	A	N	M	A	V	Y	F	T	V	L	E	H	G	D	T	V	L	G	M	N	L	S	H	G	G	H	L	T	H	G	S	P	V	N	F	S	G	V	Q	Y	N	F	V	A	Y	G	V	D	P	E	T	H
Template Known Secondary structure																		S							S	S															T	T								G	G	G	T			G	G	G	T		T	T	S						S							B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		L	G	G	I	P	R	R	E	F	T	R	D	S	I	E	E	K	V	A	A	T	T	Q	A	Q	W	P	V	H	A	V	I	T	N	S	T	Y	D	G	L	L	Y	N	T	D	W	I	K	Q	T	L	D	V	P	S	.	.	I	H	F	D	S	A	W	V	P	Y	T	H	F	H	P	I	Y	Q	G	K	S	G	M
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.																											.	.																				.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.
Template Sequence		V	.	.	.	.	.	.	.	I	D	Y	D	D	V	R	E	K	A	R	L	H	R	P	K	.	.	.	.	.	L	I	V	A	A	A	S	A	Y	P	R	I	I	D	F	A	K	F	R	E	I	A	D	E	V	G	A	Y	L	M	V	D	M	A	H	I	A	G	L	V	A	A	G	L	H	P	N	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	B															S	.	.	.	.	.							S	S			S															T								T	T	T						T	T	S	S			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.
Template SS confidence
		149								150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.						.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	E	R	V	A	G	K	V	I	F	E	T	Q	S	T	H	K	M	L	A	A	L	S	Q	A	S	L	I	H	I	K	G	E	Y	D	E	E	A	F	N	E	A	F	M	M	H	T	T	T	S	P	S	Y	P	I	V	A	S	V	E	T	A	A	A	M	L	R	G	N	P	G	K	R	L	I	N	R	S	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																						.									.
Template Conservation		.	.	.	.																						.									.
Template Sequence		.	.	.	.	P	V	P	Y	A	H	F	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	P	R	G	.	G	M	I	L	C	Q	E	Q	.	F	A	K	Q	I	D	K	A	I	F	P	G	I	Q	G	G	P	L	M	H	V	I	A	A	K	A	V	A	F	G	E	A	L	Q	D	D	F	K	A	Y	A	K	R	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S	T	T	T		S						S	S	S	T	T				S		.									.										T	T	T	T		S	S																		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																						.									.
Template SS confidence
						213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.		.	.	.	.	.	.	240	.		.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	R	A	L	H	F	R	K	E	V	Q	R	L	R	E	E	S	D	G	W	F	F	D	I	W	Q	P	P	Q	V	D	E	A	E	C	W	P	V	A	P	G	E	Q	W	H	G	F	N	D	A	D	A	D	H	M	F	L	D	P	V	K	V	T	I	L	T	P	G	M	D	E	Q	G	N	M	S	E	E	G	I
Query Conservation
Alig confidence															.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	N	A	K	R	L	A	S	A	L	Q	N	E	.	G	F	T	L	V	S	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	H	L	L	L	V	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	Q	Q	L
Template Known Secondary structure														T	.	T				G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure															.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.		300	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	310	.	.	.	.	.	.	.										.	.	320	.	.
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530											.	.	.	.	.					.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Query Sequence		P	A	A	L	V	A	K	F	L	D	E	R	G	I	V	V	E	K	T	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	L	L	F	.	.	.	.	L	F	S	I	G	I	D	K	T	K	A	M	G	L	L	R	G	L	T	E	F	K	R	S	Y	D	L	N	L	R	I	K	N	M	L	P	D	L	Y	A
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	K	T	A	E	K	V	L	D	E	V	G	I	T	V	N	K	N	T	I	P	Y	D	P	E	S	P	F	V	T	S	G	I	R	I	G	T	A	A	V	T	T	R	G	F	G	L	E	E	M	D	E	I	A	A	I	I	G	L	V	L	K	N	V	G	S	E	Q	A	L	E	E	A	R	Q	R	V	A	A
Template Known Secondary structure														T									T	T		S	S		T	T	T		S												T	T																		T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.