Job Description P52095 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:15 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 351 % Identity 15% Template d1bj4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.65

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		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.					.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.		.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.																																																			.
Query SS confidence																					.	.	.	.																																																			.
Query Sequence		A	E	E	Y	I	A	R	T	F	G	A	E	Q	S	Y	I	V	T	N	.	.	.	.	G	T	S	T	S	N	K	I	V	G	M	Y	A	A	P	S	G	S	T	L	L	I	D	R	N	C	H	K	S	L	A	H	L	L	M	M	N	D	V	V	P	V	W	L	K	P	T	R	N	A	.	L	G	I	L	G	G
Query Conservation																					.	.	.	.																																																			.
Alig confidence																					.	.	.	.																																																			.
Template Conservation
Template Sequence		C	Q	K	R	A	L	Q	A	Y	K	L	D	P	Q	C	W	G	V	N	V	Q	P	Y	S	G	S	P	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	V	E	P	H	G	R	I	M	G	L	D	L	P	D	G	G	H	L	T	H	G	F	M	T	D	K	K	K	I	S	A	T	S	I	F	F	E	S	M	P	Y	K	V	N
Template Known Secondary structure										T	T			T	T	T								S	S													T		T	T								G	G	G	T			G	G	G			B		S	S		B		S						S							B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.
Query SS confidence																																																						.	.
Query Sequence		I	P	R	R	E	F	T	R	D	S	I	E	E	K	V	A	A	T	T	Q	A	Q	W	P	V	H	A	V	I	T	N	S	T	Y	D	G	L	L	Y	N	T	D	W	I	K	Q	T	L	D	V	P	S	.	.	I	H	F	D	S	A	W	V	P	Y	T	H	F	H	P	I	Y	Q	G	K	S	G	M	S	G	E
Query Conservation																																																						.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																											.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	T	G	Y	I	N	Y	D	Q	L	E	E	N	A	R	L	F	H	P	K	.	.	.	.	.	L	I	I	A	G	T	S	C	Y	S	R	N	L	E	Y	A	R	L	R	K	I	A	D	E	N	G	A	Y	L	M	A	D	M	A	H	I	S	G	L	V	A	A	G	V	V	P	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T		S	B															S	.	.	.	.	.							S	S			S														T	T								G	G	G						T	T	S	S			.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.						.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.														.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	A	G	K	V	I	F	E	T	Q	S	T	H	K	M	L	A	A	L	S	Q	A	S	L	I	H	I	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	D	E	E	A	F	N	E	A	F	M	M	H	T	T	T	S	P	S	Y	P	I	V	A	S	V	E	T	A	A	A	M	L	R	G	N
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	P	F	E	H	C	H	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	C	R	A	G	M	I	F	Y	R	K	G	V	K	S	V	D	P	A	T	G	K	E	I	L	Y	N	L	E	S	L	I	N	S	A	V	F	P	G	L	Q	G	G	P	H	N	H	A	I	A	G	V	A	V	A	L	K	Q	A	M	T	L
Template Known Secondary structure		.	G	G	G	T		S						S	S	G	G	G				S									S						T	T	T																	T	T	T	T			S																T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	K	R	L	I	N	R	S	V	E	R	A	L	H	F	R	K	E	V	Q	R	L	R	E	E	S	D	G	W	F	F	D	I	W	Q	P	P	Q	V	D	E	A	E	C	W	P	V	A	P	G	E	Q	W	H	G	F	N	D	A	D	A	D	H	M	F	L	D	P	V	K	V	T	I	L	T	P	G	M	D
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.											.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.											.	.	.	.
Template Sequence		E	F	K	V	Y	Q	H	Q	V	V	A	N	C	R	A	L	S	E	A	L	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	Y	K	I	V	T	G	G	.	.	.	S	D	N	H	L	I	L	V	D	L	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T	S	S	.	.	.		S	S	S						G	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.											.	.	.	.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	350	.	.	.				.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.														.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	G	N	M	S	E	E	G	I	P	A	A	L	V	A	K	F	L	D	E	R	G	I	V	V	E	K	T	G	P	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	F	L	F	S	I	G	I	D	K	T	K	A	M	G	L	L	R	G	L	T	E	F	K	R	S	Y	D	L	N	L	R	I
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																																																											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	R	S	K	G	T	D	G	G	R	A	E	K	V	L	E	A	C	S	I	A	C	N	K	N	T	C	P	G	D	R	S	A	L	R	P	S	G	L	R	L	G	T	P	A	L	T	S	R	G	L	L	E	K	D	F	Q	K	V	A	H	F	I	H	R	G	I	E	L	T	L	Q	I	Q	S	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	G	G	G	T													T	T									T	T		S		T	T	S														T	T																										.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																																											.
Template SS confidence
							364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	M	L	P	D	L	Y	A	E	D	P	D	F	Y	R	N	M	R	I	Q	D	L	A	Q	G	I	H	K	L	I	R	K	H	D	L	P	G	L	M	L	R	A	F	D	T	L	P	E	M	I	M	T	P	H	Q	A	W	Q	R	Q	I	K	G	E	V	E	T	I	A	L	E	Q	L	V	G	R	V	S	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	G	V	A	A	T	L	K	E	F	K	E	R	L	A	.	.	.	.	G	D	K	Y	Q	A	A	V	Q	A	L	R	E	E	V	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T		S	S											S	.	.	.	.	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template SS confidence
																																														438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.					.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		647	.	.	650	.	.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		N	M	I	L	P	Y	P	.	P	G	V
Query Conservation									.
Alig confidence									.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	A	S	L	F	P	L	P	G	L
Template Known Secondary structure					T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480