Job Description P52095 Confidence 99.83% Date Thu Jan 5 12:05:15 GMT 2012 Rank 53 Aligned Residues 351 % Identity 13% Template c3k40B_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:aromatic-l-amino-acid decarboxylase; PDBTitle: crystal structure of drosophila 3,4-dihydroxyphenylalanine2 decarboxylase Resolution 1.75 Å

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		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.				.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.
Query Sequence		F	T	K	A	L	F	T	Y	V	K	E	R	K	Y	T	F	C	.	.	.	T	P	G	H	M	G	G	T	A	Y	Q	K	S	P	V	G	C	L	F	Y	D	F	F	G	G	N	T	L	K	A	D	V	S	I	S	V	T	E	L	G	S	L	L	D	H	T	G	P	H	L	E	A	E	E	Y	I	A	R	T	F
Query Conservation																			.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	M	Q	D	I	E	R	V	I	M	P	G	V	T	H	W	H	S	P	K	F	H	A	Y	F	P	T	A	N	S	Y	P	A	I	V	A	D	M	L	S	G	A	I	A	C	I	G	F	T	W	I	A	S	P	A	C	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	V	V	M	M	D	W	L	G	K	M	L
Template Known Secondary structure										T	G	G	G				T	T		T	T	B			S	S																						S	S	S										.	.	.	.	.	.	.	.	.													T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.										.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		209	210	.	.	.	.	.											.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	E	Q	S	Y	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	N	G	T	S	T	S	N	K	I	V	G	M	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	S	G	S	T	L	L	I	D	R	N	C	H	K	S	L	A	H	L	L	M	M	N	D	V	V	P
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	P	A	E	F	L	A	C	S	G	G	K	G	G	G	V	I	Q	G	T	A	S	E	S	T	L	V	A	L	L	G	A	K	A	K	K	L	K	E	V	K	E	L	H	P	E	W	D	E	H	T	I	L	G	K	L	V	G	Y	C	S	D	Q	A	H	S	S	V	E	R	A	G	L	L	G	G	V	K	L
Template Known Secondary structure		T			G	G	G		G	G	G	T	S	S							S																										T	T	S							T	T							T	T	S												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.																.																		.	.
Query SS confidence																																					.																.																		.	.
Query Sequence		V	W	L	K	P	T	R	N	A	L	G	I	L	G	G	I	P	R	R	E	F	T	R	D	S	I	E	E	K	V	A	A	T	T	Q	.	A	Q	W	P	V	H	A	V	I	T	N	S	T	Y	D	.	G	L	L	Y	N	T	D	W	I	K	Q	T	L	D	V	P	S	.	.	I	H	F	D	S	A	W	V	P
Query Conservation																																					.																.																		.	.
Alig confidence						.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.															.																.																		.	.
Template Conservation						.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	S	V	Q	.	.	.	S	E	N	H	R	M	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	A	A	L	E	K	A	I	E	Q	D	V	A	E	G	L	I	P	F	Y	A	V	V	T	L	G	T	T	N	S	C	A	F	D	Y	L	D	E	C	G	P	V	G	N	K	H	N	L	W	I	H	V	D	A	A	Y	A	G
Template Known Secondary structure						.	.	.		B	T	T	B		.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	T										B	S		T	T	T			B													T	T								T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		207	.	.	210				.	.	.	.	.	.									.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	T	H	F	H	P	I	Y	Q	G	K	S	G	M	S	G	E	R	V	A	G	K	V	I	F	E	T	Q	S	T	H	K	M	L	A	A	L	S	Q	A	S	L	I	H	I	K	G	E	Y	D	E	E	A	F	N	E	A	F	M	M	H	T	T	T	S	P	S	Y	P	I	V	A	S	V	E	T	A	A	A	M
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Sequence		S	A	F	I	C	P	E	Y	R	H	L	M	.	.	.	.	.	K	G	I	E	S	A	D	S	F	N	F	N	P	H	W	M	L	V	N	F	D	C	S	A	M	W	L	K	D	P	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	G	R	R	F	R	A	L	.	.	K	L	W	F	V	L	R	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	S	G	G	G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	T	T	G	G	G		S										S			S	S							S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					G	G	G				.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.						.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.												320	.	.	.	.	.	.	.	.	.			330	.	.	.	.	.	.	.
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	G	N	P	G	K	R	L	I	N	R	S	V	E	R	A	L	H	F	R	K	E	V	Q	R	L	R	E	E	S	D	G	W	F	F	D	I	W	Q	P	P	Q	V	D	E	A	E	C	W	P	V	A	P	G	E	Q	W	H	G	F	N	D	A	D	A	D	H	M	F	L	D	P	V	K	V	T	I	L	T
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	V	E	N	L	Q	A	H	I	R	R	H	C	N	F	A	K	Q	F	G	D	L	C	V	A	D	S	R	.	.	.	.	.	.	F	E	L	A	A	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	M	G	L	V	C	F	R	L
Template Known Secondary structure																											T	S	T	T	.	.	.	.	.	.				S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.							.	.	.	.	.	400	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	410
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.				.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.			.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.													.	.
Query SS confidence																													.	.	.													.	.
Query Sequence		P	G	M	D	E	Q	G	N	M	S	E	E	G	I	P	A	A	L	V	A	K	F	L	D	E	R	G	.	.	.	I	V	V	E	K	T	G	P	Y	N	L	L	.	.	F	L	F	S	I	G	I	D	K	T	K	A	M	G	L	L	R	G	L	T	E	F	K	R	S	Y	D	L	N	L
Query Conservation																													.	.	.													.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.													.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	S	N	E	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	L	L	K	R	I	N	G	R	G	H	I	H	L	V	P	A	K	I	K	D	V	Y	F	L	R	M	A	I	C	S	R	F	T	Q	S	E	D	M	E	Y	S	W	K	E	V	S	A	A	A	D	E	M	E	Q	E	Q
Template Known Secondary structure		S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	S		B							T	T											T	T																						T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.										.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.