Job Description P52095 Confidence 99.00% Date Thu Jan 5 12:05:15 GMT 2012 Rank 231 Aligned Residues 325 % Identity 10% Template c2zy3A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:l-aspartate beta-decarboxylase; PDBTitle: dodecameric l-aspartate beta-decarboxylase Resolution 2.50 Å

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		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.											.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.						.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Query Sequence		G	S	L	L	D	H	T	G	P	H	L	E	A	E	E	Y	I	A	R	T	F	G	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	Y	I	V	T	N	G	T	S	T	S	N	K	I	V	G	M	Y	A	.	.	.	.	.	A	P	S	G	S	T	L	L	I	D	R	N	C	H	K	S	L	A	H	L	L
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	N	Y	P	V	P	P	R	M	L	N	I	S	E	K	I	V	R	Q	Y	I	I	R	E	M	G	A	D	A	I	P	S	E	S	V	N	L	F	A	V	E	G	G	T	A	A	M	A	Y	I	F	E	S	L	K	L	N	G	L	L	K	A	G	D	K	V	A	I	G	M	P	V	F	T	P	Y	I	E	I	P
Template Known Secondary structure			S			S	S	T	T																	T	T		T	T	S		G	G	G							S																T	T	S	S		T	T								S			T					S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		253	.			.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.		.	.	.	310	.	.				.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.																																																					.							.	.	.
Query SS confidence				.	.																																																					.							.	.	.
Query Sequence		M	M	.	.	N	D	V	V	P	V	W	L	K	P	T	R	N	A	L	G	I	L	G	G	I	P	R	R	E	F	T	R	D	S	I	E	E	K	V	A	A	T	T	Q	A	Q	W	P	V	H	A	V	I	T	N	S	.	T	Y	D	G	L	L	.	.	.	Y	N	T	D	W	I	K	Q	T	L	D	V	P	S
Query Conservation				.	.																																																					.							.	.	.
Alig confidence				.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.							.							.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	A	Q	Y	A	L	E	E	V	A	I	N	A	D	P	S	L	N	W	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	S	E	L	D	K	L	K	D	P	A	I	K	I	.	.	.	.	.	F	F	C	V	N	P	S	N	P	P	S	V	K	M	D	Q	R	S	L	E	R	V	R	N	I	V	A	E	H	R
Template Known Secondary structure		T	S	T	T	T										B	G	G	G	T	S	B		.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	G		T	T				.	.	.	.	.					S	S		S	S	S		B																	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.									.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.						.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
						327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.			370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																												.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																												.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	I	H	F	D	S	A	W	V	P	Y	T	H	F	H	P	I	Y	Q	G	K	S	G	M	S	G	E	R	V	A	G	K	V	I	F	E	T	Q	S	T	H	K	M	L	.	.	A	A	L	S	Q	A	S	L	I	H	I	K	G	E	Y	D	E	E	A	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.																																												.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.									.								.	.	.	.	.	.	.																					.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	L	M	I	L	T	D	D	V	Y	G	.	T	F	A	D	D	F	Q	.	.	.	.	.	.	.	S	L	F	A	I	C	P	E	N	T	L	L	V	Y	S	F	S	K	Y	F	G	A	T	G	W	R	L	G	V	V	A	A	H	Q	Q	N	V	F	D	L	A	L	D	K	L	Q	E	S	E	K	V	A	L
Template Known Secondary structure		T	T								T	T	G	.	G	G	S	S	S			.	.	.	.	.	.	.							G	G	G							S	T	T	T	T	T		G	G	G									S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure														.								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290		.	.	.	.	.	.	.								.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
																										391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	F	M	M	H	T	T	T	S	P	S	Y	P	I	V	A	S	V	E	T	A	A	A	M	L	R	G	N	P	G	K	R	L	I	N	R	S	V	E	R	A	L	H	F	R	K	E	V	Q	R	L	R	E	E	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	H	R	Y	R	S	L	L	P	D	V	R	S	L	K	F	I	D	R	L	V	A	D	S	R	A	V	A	L	N	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	V	Q	M	A	L	F	S	L	F	A	L	M	D	E	A	D	E	Y	K	H	T	L	K	Q	L	I	R	R	R	E	T	T	L	Y	R	E	L	G	M	P
Template Known Secondary structure					T	T	T	T		S		G	G	G											T	T	T	T	T	T	G	G	G		S	S																			T	T																			T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	W	F	F	D	I	W	Q	P	P	Q	V	D	E	A	E	C	W	P	V	A	P	G	E	Q	W	H	G	F	N	D	A	D	A	D	H	M	F	L	D	P	V	K	V	T	I	L	T	P	G	M	D	E	Q	G	N	M	S	E	E	G	I	P	A	A	L	V	A	K	F	L	D	E	R	G	I	V	V	E
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	R	D	E	N	A	V	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	T	L	I	D	L	Q	D	V	T	A	K	L	Y	G	E	A	F	S	E	W	A	V	K	Q	S	S	T	G	D	M	L	F	R	I	A	D	E	T	G	I	V	L	L
Template Known Secondary structure						T	T	B			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
		527						.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.
Query Sequence		K	.	.	.	.	.	T	G	P	Y	N	L	L	F	L	F	S	I	G	I	D	K	T	K	A	M	G	L	L	R	G	L	T	E	F	K	R	S	Y
Query Conservation			.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.												.
Template Conservation																			.
Template Sequence		P	G	R	G	F	G	S	N	R	P	S	G	R	A	S	L	A	.	N	L	N	E	Y	E	Y	A	A	I	G	R	A	L	R	K	M	A	D	E	L
Template Known Secondary structure					S	S		T	T	S							S	S	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.		.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.