Job Description P52095 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:15 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 406 % Identity 23% Template c2x3lA_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:orn/lys/arg decarboxylase family protein; PDBTitle: crystal structure of the orn_lys_arg decarboxylase family2 protein sar0482 from methicillin-resistant staphylococcus3 aureus Resolution 2.00 Å

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		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	T	K	A	L	F	T	Y	V	K	E	R	K	Y	T	F	C	T	P	G	H	M	G	G	T	A	Y	Q	K	S	P	V	G	C	L	F	Y	D	F	F	G	G	N	T	L	K	A	D	V	S	I	S	V	T	E	L	G	S	L	L	D	H	T	G	P	H	L	E	A	E	E	Y	I	A	R	T	F	G	A
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																									.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																									.
Template Sequence		P	I	L	N	K	L	E	S	L	N	Q	E	E	A	I	S	L	H	V	P	G	H	K	N	M	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	L	S	Q	L	S	M	T	M	D	K	T	.	E	I	P	G	L	D	D	L	H	H	P	E	E	V	I	L	K	S	M	K	Q	V	E	K	.	H	S	D
Template Known Secondary structure													T	T					S	S	S	T	T	T	T	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	G	G	G			G	G	G				.	S		T	T	S			T	T	S		S	S											S	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																									.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.												.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.		.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.		.	70	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	S	Y	I	V	T	N	G	T	S	T	S	N	K	I	V	G	M	Y	A	A	P	S	G	S	T	L	L	I	D	R	N	C	H	K	S	L	A	H	L	L	M	M	N	D	V	V	P	V	W	L	K	P	T	R	N	A	L	G	I	L	G	G	I	P	R	R	E	F	T	R	D	S	I	E	E	K	V	A
Query Conservation
Alig confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	G	Y	F	L	V	N	G	T	T	S	G	I	L	S	V	I	Q	S	F	S	Q	K	K	G	D	I	L	M	A	R	N	V	H	K	S	V	L	H	A	L	D	I	S	Q	Q	E	G	H	F	I	E	T	H	Q	S	P	L	T	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N
Template Known Secondary structure								S	S												T	T	T	T	S	S	S						T	T													T												T	T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.																	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.
Query SS confidence																																						.	.
Query Sequence		A	T	T	Q	A	Q	W	P	V	H	A	V	I	T	N	S	T	Y	D	G	L	L	Y	N	T	D	W	I	K	Q	T	L	D	V	P	S	.	.	I	H	F	D	S	A	W	V	P	Y	T	H	F	H	P	I	Y	Q	G	K	S	G	M	S	G	E	R	V	A	G	K	V	I	F	E	T	Q	S	T	H	K	M
Query Conservation																																						.	.
Alig confidence									.	.	.																											.	.																.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation									.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		K	V	N	L	H	K	L	.	.	.	V	V	L	T	Y	P	N	Y	Y	G	E	T	F	N	V	E	E	V	I	K	S	L	H	Q	L	N	I	P	V	L	I	D	E	A	H	G	A	H	F	G	L	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	F	P	D	S	T	L	N	Y	Q	A	D	Y	V	V	Q	S	F	H	T	.
Template Known Secondary structure									.	.	.					S	S		T	T	S															T	T								T	T		T	T	T	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	S				G	G	G	G	T		S									.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.				.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.								.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.		.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		L	A	A	L	S	Q	A	S	L	I	H	I	K	G	E	.	Y	D	E	E	A	F	N	E	A	F	M	M	H	T	T	T	S	P	S	Y	P	I	V	A	S	V	E	T	A	A	A	M	L	R	G	N	P	G	K	R	L	I	N	R	S	V	E	R	A	L	H	F	R	K	E	V	Q	R	L	R	E	E	S	D
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	A	L	T	M	G	S	V	L	Y	I	H	K	N	A	P	Y	R	E	N	I	I	E	Y	L	S	Y	F	Q	T	S	S	P	S	Y	L	I	M	A	S	L	E	S	A	A	Q	F	Y	K	T	Y	D	S	T	L	F	F	A	K	R	A	Q	L	I	E	C	L	E	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S		T	T								T	T		T	T												S		S	S																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	W	F	F	D	I	W	Q	P	P	Q	V	D	E	A	E	C	W	P	V	A	P	G	E	Q	W	H	G	F	N	D	A	D	A	D	H	M	F	L	D	P	V	K	V	T	I	L	T	P	G	M	D	E	Q	G	N	M	S	E	E	G	I	P	A	A	L	V	A	K	F	L	D	E	R	G	I	V	V	E	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	E	M	L	Q	V	D	.	.	.	.	D	P	L	K	L	L	I	K	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	T	G	H	D	I	Q	N	W	F	M	N	A	H	I	Y	L	E	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							S	.	.	.	.	S	T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S												T	T				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													284	.	.	.	.	.	290	.					.	.	.	.	.	.	.	.	300	.												.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.			.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.
Query SS confidence																				.	.
Query Sequence		T	G	P	Y	N	L	L	F	L	F	S	I	G	I	D	K	T	K	.	.	A	M	G	L	L	R	G	L	T	E	F	K	R	S	Y	D	L	N	L	R	I	K	N	M	L	P	D	L	Y	A	E	D	P	D	F	Y	R	N	M	R	I	Q	D	L	A	Q	G	I	H	K	L	I	R	K	H	D	L	P	G	L
Query Conservation																				.	.
Alig confidence																				.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	D	Y	Q	A	L	A	I	L	P	L	W	H	H	D	D	T	Y	L	F	D	S	L	L	R	K	I	E	D	M	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S											T	T														T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	R	A	F	D	T	L	P	E	M	I	M	T	P	H	Q	A	W	Q	R	Q	I	K	G	E	V	E	T	I	A	L	E	Q	L	V	G	R	V	S	A	N	M	I	L	P	Y	P	P	G	V	P	L	L	M	P	G	E	M	L	T	K	E	S	R	T	V	L	D	F	L	L	M	L	C	S	V	G	Q	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.																																							.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.																																							.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	L	P	K	K	S	T	Q	L	L	T	T	E	G	N	Y	.	.	.	.	.	K	P	K	W	C	D	L	K	K	A	K	G	K	V	L	A	R	H	I	V	P	Y	P	P	G	I	P	I	I	F	K	G	E	T	I	T	E	N	.	.	.	M	I	E	L	V	N	E	Y	L	E	T	G	M	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.							G	G	G		T	T	S	B			S		B				T	T		S		S	B		T	T	B	B					.	.	.											T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.																																							.	.	.
Template SS confidence
							354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.						.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.				.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		686	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	E	G
Template Known Secondary structure				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		433	.	.