Job Description P77473 Confidence 31.74% Date Thu Jan 5 12:29:36 GMT 2012
Rank 321 Aligned Residues 134
% Identity 11% Template c3ks6A_
PDB info
PDB header: hydrolaseChain: A: PDB Molecule: glycerophosphoryl diester phosphodiesterase;
PDBTitle: crystal structure of putative glycerophosphoryl diester2 phosphodiesterase (17743486) from agrobacterium tumefaciens3 str. c58 (dupont) at 1.80 a resolution
Resolution 1.80 Å
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344 . . . . . 350 . . . . . . . . . 360 . . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420 . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
E D M G D W L R Q H P Q Q H I S I N L E S P V L T S E K I P Q L L R D M I N H Y Q V N P R Q I A L E L T E R E F A D P K T S A P I I S R Y R E A G H E I Y L D D
Query Conservation  
                                                                                                                             
Alig confidence  
. . . . . . . . . .
Template Conservation  
                                                                                                    . . . . . . . . . .                                  
Template Sequence  
E L C A L Y V D S H V N F R C E I K P G V D G L P Y E G F V A L V I A G L E R H S X L E R T T F S S F L L .
.
.
.
.
.
.
.
.
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A S X D E L W K A T T R P R L W L
Template Known Secondary structure  
T T S T T S T T T T G G G S . . . . . . . . . . S
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
89 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 .
. . . . . . . . 150 . . . . . . . .
 
   
424 . . . .
. 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480 . . . . . . . . . 490 . . . . .
Predicted Secondary structure  
. . . . . . .
Query SS confidence  
.
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.
.
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.
.
Query Sequence  
F G T G Y .
.
.
.
.
.
.
S S L S Y L Q D L D V D I L K I D K S F V D A L E Y K N V T P H I I E M A K T L K L K M V A E G I E T S K Q E E W L R Q H G V H Y G Q
Query Conservation  
      . . . . . . .                                                                                      
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
                                                                    . . . . . . . .                                                        
Template Sequence  
V S P S V L Q Q L G P G A V I E T A I A H S I H E I G V H I D T A D .
.
.
.
.
.
.
.
A G L X A Q V Q A A G L D F G C W A A H T P S Q I T K A L D L G V K V F T
Template Known Secondary structure  
T T G G G . . . . . . . . T T S T S
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . .
Template SS confidence  
   
159 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . .
. . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]