Job Description P77473 Confidence 98.77% Date Thu Jan 5 12:29:36 GMT 2012
Rank 23 Aligned Residues 146
% Identity 7% Template c3hvwA_
PDB info
PDB header: lyaseChain: A: PDB Molecule: diguanylate-cyclase (dgc);
PDBTitle: crystal structure of the ggdef domain of the pa2567 protein2 from pseudomonas aeruginosa, northeast structural genomics3 consortium target par365c
Resolution 1.70 Å
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109 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . .
. . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . .
Predicted Secondary structure  
. . .
Query SS confidence  
.
.
.
Query Sequence  
E H E S P P D T F P E P G K I S K D G Y R V W L T .
.
.
S H N D L G I I R Y M V A M G T A H Y V V M I D P A S F I D V I P Y S S W Q I D A A I I G N A H N V V I
Query Conservation  
                                          . . .                                                                                            
Alig confidence  
. . . .
Template Conservation  
                                                                                      .                      
Template Sequence  
Y N R L R L Q E D V S L R L Q R D G A L T V I A A D L L P L A L L N T I I R T L G Y P F S N D L X L E A R D R I R A E L P D .
F T L Y K I S P T R F G L L L P R
Template Known Secondary structure  
S S T T . S T T G
Template Predicted Secondary structure  
.
Template SS confidence  
   
175 . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . .
. . . 240 . . . . . . . . . 250 . . .
 
   
186 . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 .
. . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . .
Predicted Secondary structure  
.
Query SS confidence  
.
Query Sequence  
T S S D E I A Q G I I T R L Q K T P G E H I E N N G I I Y D I L P L P E M N I S I I T W A S .
T K M L Q K G W H R Q V F I W L P L G L V I G L L
Query Conservation  
                                                                                          .                                      
Alig confidence  
. .
Template Conservation  
  .                                                                                                                
Template Sequence  
Q .
Q Q E E T E S V C L R L L R A F E S P V V C R G I P I K A N V G L G V L P L A D D T L D G D Q D W L R L V V S A A D D A R D R G V G W A R Y
Template Known Secondary structure  
G . G G G G T T S T T G G G T G G G S T S
Template Predicted Secondary structure  
.
Template SS confidence  
   
254
. . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300 . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]