Job Description P00811 Confidence 97.36% Date Thu Jan 5 10:56:54 GMT 2012 Rank 72 Aligned Residues 192 % Identity 11% Template d1xa1a_ SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 1.80

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		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.			.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure																																						.	.
Query SS confidence																																						.	.
Query Sequence		Q	T	L	F	E	L	G	S	V	S	K	T	F	T	G	V	L	G	G	D	A	I	A	R	G	E	I	K	L	S	D	P	T	T	K	Y	.	.	W	P	E	L	T	A	K	Q	W	N	G	I	T	L	L	H	L	A	T	Y	T	A	G	G	L	P	L	Q	V	P	D	E	V	K	S	S	S	D	L	L	R	F
Query Conservation																																						.	.
Alig confidence																			.	.	.																	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	R	Y	S	P	N	S	T	Y	K	I	Y	L	A	M	F	.	.	.	G	L	D	R	H	I	I	N	D	E	N	S	R	M	S	W	N	H	K	H	Y	P	F	D	A	W	N	K	E	Q	D	L	N	T	A	M	Q	N	S	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T						G	G	G	G								.	.	.				T	T	S	S		S	S				B				S				S	S	G	G	G	S	S		B									T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Q	N	W	Q	P	A	W	A	P	G	T	Q	R	L	Y	A	N	S	S	I	G	L	F	G	A	L	A	V	K	P	S	G	L	S	F	E	Q	A	M	Q	T	R	V	F	Q	P	L	K	L	N	H	T	W	I	N	V	P	P	A	E	E	K	N	Y	A	W	G	Y	R	E	G	K	A	V	H	V	S	P	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Y	F	E	R	I	S	D	Q	I	P	K	N	Y	T	A	T	Q	L	K	Q	.	.	.	.	.	L	N	Y	G	N	K	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S												.	.	.	.	.		T		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130						.	.	.	.	.	.	.	.																							.	140	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	D	A	E	A	Y	G	V	K	S	T	I	E	D	M	A	R	W	V	Q	S	N	L	K	P	L	D	I	N	E	K	T	L	Q	Q	G	I	Q	L	A	Q	S	R	Y	W	Q	T	G	D	M	Y	Q	G	L	G	W	E	M	L	D	W	P	V	N	P	D	S	I	I	N	G	S	D	N	K	I	A	L	A
Query Conservation
Alig confidence																													.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	Y	W	M	E	D	S	L	K	I	S	N	L	E	Q	V	I	V	F	K	N	M	M	E	N	H	.	F	S	K	K	A	K	N	Q	L	S	S	S	L	L	I	K	K	N	E	K	Y	E	L	Y	G	K	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	T	T	S	S	S	S																				.	S																		S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.		.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.				350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.
Query Sequence		A	R	P	V	K	A	I	T	P	P	T	P	A	V	R	A	S	W	V	H	K	T	G	A	T	G	G	F	G	S	Y	V	A	F	I	P	E	K	E	.	.	.	L	G	I	V	M	L	A	N	K	N	Y	P	N	P	A	R	V	D	A	A	W	Q	I	L	N	A	L	Q
Query Conservation																																									.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	I	V	N	G	K	Y	N	N	G	W	F	V	G	Y	V	I	T	N	H	D	K	Y	Y	F	A	T	H	L	S	D	G	K	P	S	G	K	N	A	E	L	I	S	E	K	I	L	K	E	M	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T														S	S												S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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