Job Description P77374 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:16 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 576 % Identity 22% Template d1ogya2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 3.2

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		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.				.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.
Query Sequence		K	V	V	W	G	A	C	S	V	N	C	G	S	R	C	A	L	R	L	H	V	K	D	N	E	V	T	W	V	E	T	D	N	T	G	S	D	E	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	I	N	H	P	D	R	L	N	Y	P	M	K	R	V	G	K	.	.	.	R	G	E	G	K
Query Conservation																																																																										.	.	.
Alig confidence											.																							.	.	.	.																																					.	.	.
Template Conservation											.																							.	.	.	.
Template Sequence		R	W	S	K	A	P	C	R	F	.	C	G	T	G	C	G	V	M	V	G	T	R	D	G	Q	V	V	A	T	H	G	D	.	.	.	.	T	Q	A	E	V	N	R	G	L	N	C	V	K	G	Y	F	L	S	K	I	M	Y	G	E	D	R	L	T	T	P	L	L	R	M	K	D	G	V	Y	H	K	E	G	E
Template Known Secondary structure									S	S	.		S	S										T	T									.	.	.	.	T	T		T	T	T	S	S								G	G	G	G	S	T	T		T	T				S				S		S	S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure											.																							.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.					.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.			.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	A	S	S	L	K	K	T	V	E	Q	Y	G	N	E	A	V	Y	I	Q	Y	S	S	G	I	V	G	G	N	M	T	R	S	S	P	S	A	S	A	V	K	R	L	M	N	C	Y	G	G	S	L	N	Q	.	.	Y	G	S	Y	S	T	A	Q	I	S	C	A	M
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	P	V	S	W	D	E	A	F	D	V	M	A	A	Q	A	K	L	V	L	K	E	K	A	P	E	A	V	G	M	F	G	S	G	.	.	.	.	.	.	.	Q	W	T	I	W	E	G	Y	A	A	S	K	L	M	R	A	G	F	R	S	N	N	L	D	P	N	A	R	H	C	M	A	S	A	A	T	A	F
Template Known Secondary structure																									T		G	G	G							T	.	.	.	.	.	.	.	T	S														T	T	S								T					T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.								.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		205	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		P	Y	T	Y	G	.	S	N	D	G	N	S	T	T	D	I	E	N	S	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	G	G	G	I	T	Y	L	L	E	K	A	R	E	K	S	N	A	K	M	I	V	I	D	P	R	Y	T	D	T	A	A	G	R	E	D	E	W	L	P	I	R	P	G	T	D
Query Conservation							.
Alig confidence							.																														.	.																														.
Template Conservation																																					.	.																														.
Template Sequence		M	R	T	F	G	M	D	E	P	M	G	C	Y	D	D	F	E	A	A	D	A	F	V	L	W	G	S	N	M	A	E	M	H	P	I	.	.	L	W	S	R	L	T	D	R	R	L	S	H	E	H	V	R	V	A	V	L	S	T	F	T	H	R	S	S	D	.	L	S	D	T	P	I	I	F	R	P	G	T	D
Template Known Secondary structure						S	S		S		S	S		T	T						S						S							S			.	.												S	T	T								S	S			G	G	G	G	.	S		S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.																														.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.			.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.																.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	L	V	A	G	I	A	W	V	L	I	N	E	N	L	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	E	K	T	L	P	A	D	A	P	K	N	G	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	D	D	K	T	A	K	T	P	Q	W	A	S	Q
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	I	L	N	Y	I	A	H	H	I	I	S	T	G	R	V	N	R	D	F	V	D	R	H	T	N	F	A	L	G	A	T	D	I	G	Y	G	L	R	P	E	H	Q	L	Q	L	A	A	K	G	A	A	D	A	G	A	M	T	P	T	D	F	E	T	F	A	A	L	V	S	E	Y	T	L	E	K	A	A	E
Template Known Secondary structure															T	T																		S	S			T	T			T	T	S					S		T	T		S	S		S				B												T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure																							.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	T	G	I	P	E	D	R	I	I	K	L	A	R	E	I	G	T	A	K	P	.	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	Q	A	N	G	E	L	T	A	R	A	I	A	M	L	P	I	L	T	G	N	V	G	I	S	G	G	N	S	G	A	R	E	S	T	Y	T	I	T	I	E	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																							.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	G	V	E	P	A	L	L	E	E	L	A	E	L	Y	A	D	P	D	R	K	W	M	S	L	W	T	M	G	F	N	Q	H	V	R	G	V	W	A	N	H	M	V	Y	N	L	H	L	L	T	G	K	I	S	E	P	G	N	S	P	F	S	L	T	G	Q	P	F	A	C	G	T	A	R	E	V	G	T	F
Template Known Secondary structure																	T	T	S	T	T	S							S					S	S	T	T																T			S	B	T	T	B								S	T	T	T	T	T	T					T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
							421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	R	L	P	V	L	D	N	P	V	K	T	S	I	S	C	F	S	W	T	D	A	I	D	H	G	P	Q	M	T	A	I	R	D	G	V	R	G	K	D	K	L	D	V	P	I	K	F	I	W	N	Y	A	G	N	T	L	V	N	Q	H	S	D	I	N	K	T	H	E	I	L	Q	D	E	S	K
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																												.													.
Template Conservation																																																																		.													.
Template Sequence		A	H	R	L	P	A	D	M	V	V	T	N	P	E	H	R	A	H	A	E	E	I	W	K	L	P	A	G	L	L	P	D	W	V	G	A	H	A	V	E	Q	D	R	K	L	H	D	G	E	I	N	F	Y	W	V	Q	V	N	N	N	M	Q	A	A	.	P	N	I	D	Q	E	T	Y	P	G	Y	R	.	N	P
Template Known Secondary structure		T	T			T	T	T			S	S												T	T			T	T		S			S															T	S								S							S	.	T	T											.		T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.													.
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.		.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.		.	.
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	E	M	I	V	V	I	E	N	F	M	T	S	S	A	K	Y	A	D	I	L	L	P	D	L	M	T	V	E	Q	E	D	I	I	P	N	D	Y	A	G	N	M	G	Y	L	I	F	L	Q	P	V	T	S	E	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	I	L	S	E	V	A	K	R	L	G	P	D	V	Y	Q	K	F
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.
Template Sequence		E	N	F	I	V	V	S	D	A	Y	P	T	V	T	G	R	A	A	D	L	V	L	P	A	A	M	W	V	E	K	E	.	.	.	.	G	A	Y	G	N	A	E	R	R	T	H	F	W	H	Q	L	V	E	A	P	G	E	A	R	S	D	L	W	Q	L	M	E	F	S	K	R	F	T	T	D	E	V	W	P	E
Template Known Secondary structure		T								S	S							T	S	S					B			G	G	G	S		.	.	.	.						T	T	S							B		S			S	T	T		B											T	T							S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.					.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
																																													576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	G	R	T	Q	E	Q	W	L	Q	H	L	Y	A	K	M	L	A	K	D	P	A	L	P	S	Y	D	E	L	K	K	M	G	I	Y	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	L	S	A	A	P	A	Y	R	G	K	T	L	F	E	V	L	F	A	N	G	S	V	D	R	F	P	A	S	D	V	N	P	D	H	A	N	H	E	A	A	L	F	G	F	Y	P	Q	K	G	L	F	E	E	Y	A	A	F	G	R	G	H	G	H	D	L	A	P	F	D	T	Y	H	E	V	R	G	L	H
Template Known Secondary structure								S	S	S	S	S			T	T	T	T	T	T		S	S	S	S	S		S	B	S	S	S	S		S	S	S	B						S	S	S	B												T	T	S	S	S	S	S						T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630								.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	K	D	P	N	G	H	F	V	A	Y	K	A	F	R	D	D	P	.	.	.	.	.	.	.	E	A	N	P	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	P	V	V	E	G	E	E	T	R	W	R	Y	R	E	G	F	D	P	Y	V	K	P	G	E	G	L	R	F	Y	G	K	P	D	G	R	A	V	I	L	G
Template Known Secondary structure		S			B	T	T	B			S	S	S	S	B	B	T	T	B	T	T	S		S	S		S	B			T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		632	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.