Job Description P77374 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:16 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 631 % Identity 22% Template d1h0ha2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.8

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70			.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.
Query SS confidence																																	.	.
Query Sequence		A	A	A	A	V	Q	Q	A	R	E	K	V	V	W	G	A	C	S	V	N	C	G	S	R	C	A	L	R	L	H	V	.	.	K	D	N	E	V	T	W	V	E	T	D	N	T	G	S	D	E	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	I	N	H	P	D	R	L	N	Y	P	M	K
Query Conservation																																	.	.
Alig confidence																					.												.	.												.	.	.	.
Template Conservation																					.																									.	.	.	.
Template Sequence		A	T	M	A	L	K	T	V	D	A	K	Q	T	T	S	V	C	C	Y	.	C	S	V	G	C	G	L	I	V	H	T	D	K	K	T	N	R	A	I	N	V	E	G	D	.	.	.	.	P	D	H	P	I	N	E	G	S	L	C	A	K	G	A	S	T	W	Q	L	A	E	N	E	R	R	P	A	N	P	L	Y
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	S								S	S	.	B	T	T										T	T	T										.	.	.	.	T	T		T	T	T	T	T								T						S		T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																					.																									.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.					.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.													.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	G	K	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	A	S	S	L	K	K	T	V	E	Q	Y	G	N	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Y	I	Q	Y	S	S	G	I	V	G	G	N	M	T	R	S	S	P	S	A	S	A	V	K	R	L	M	N	C	Y
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	P	.	.	G	S	D	Q	W	E	E	K	S	W	D	W	M	L	D	T	I	A	E	R	V	A	K	T	R	E	A	T	F	V	T	K	N	A	K	G	Q	V	V	N	R	C	D	G	I	A	S	V	G	S	A	.	.	.	.	.	.	.	A	M	D	N	E	E	C	W	I	Y	Q	A	W	L	R	S	L
Template Known Secondary structure				T	.	.	T		S	S																														T	T	S								S							T	.	.	.	.	.	.	.	T	S															T
Template Predicted Secondary structure					.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.			.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.								130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.
Query SS confidence																										.
Query Sequence		G	G	S	L	N	Q	Y	G	S	Y	S	T	A	Q	I	S	C	A	M	P	Y	T	Y	G	.	S	N	D	G	N	S	T	T	D	I	E	N	S	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	G	G	G	I	T	Y	L	L	E	K	A	R	E	K	S	N	A	K	M	I	V	I	D	P	R	Y
Query Conservation																										.
Alig confidence																										.																																					.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.
Template Sequence		G	L	F	Y	I	E	H	Q	A	R	I	H	S	A	T	V	A	A	L	A	E	S	Y	G	R	G	A	M	T	N	H	W	I	D	L	K	N	S	D	V	I	L	M	M	G	S	N	P	A	E	N	H	P	I	S	F	K	W	V	M	R	.	.	.	.	A	K	D	K	G	A	T	L	I	H	V	D	P	R	Y
Template Known Secondary structure		T	B						G	G	G														S			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S	T	T								.	.	.	.				T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.
Template SS confidence
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.					.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	D	T	A	A	G	R	E	D	E	W	L	P	I	R	P	G	T	D	A	A	L	V	A	G	I	A	W	V	L	I	N	E	N	L	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.
Template Sequence		T	R	T	S	T	.	K	C	D	L	Y	A	P	L	R	S	G	S	D	I	A	F	L	N	G	M	T	K	Y	I	L	E	K	E	L	Y	F	K	D	Y	V	V	N	Y	T	N	A	S	F	I	V	G	E	G	F	A	F	E	E	G	L	F	A	G	Y	N	K	E	T	R	K	Y	D	K	S	K	W	G	F	E
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	.	G		S							T	T																T	T		S									B	G	G	G	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T				G	G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.		.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.					.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	E	K	T	L	P	A	D	A	P	K	N	G	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	D	D	K	T	A	K	T	P	Q	W	A	S	Q	I	T	G	I	P	E	D	R	I	I	K	L	A	R	E	I	G	T	A	.	.	.	.	K	P	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	Q	A	N	G	E	L	T
Query Conservation																																																										.	.	.	.
Alig confidence																																																										.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	D	E	N	G	N	P	K	R	D	E	T	L	K	H	P	R	C	V	F	Q	I	M	K	K	H	Y	E	R	Y	D	L	D	K	I	S	A	I	C	G	T	P	K	E	L	I	L	K	V	Y	D	A	Y	C	A	T	G	K	P	D	K	A	G	T	I	M	Y	A	M	G	W	T	Q	H	T	V	G	V	Q	N
Template Known Secondary structure		B		T	T	S		B		B		T	T	S		S	T	T	B										T	T																										G	G	G	S	T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	A	I	A	M	L	P	I	L	T	G	N	V	G	I	S	G	G	N	S	G	A	R	E	S	T	Y	T	I	T	I	E	R	L	P	V	L	D	N	P	V	K	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	R	A	M	S	I	N	Q	L	L	L	G	N	I	G	V	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	E	A	N	V	Q	G	S	T	D	H	G	L	L	M	H	I	Y	P	G	Y	L	G	T	A	R	A	S	I	P	T	Y	E	E	Y	T	K	K	F	T	P	V	S	K	D	P	Q	S	A	N	W	W	S	N	F
Template Known Secondary structure												T	T		S	S	S	T	T		S						S	B	T	T							T	T		B	T	T			T	T	T					B	T	T			S															T	T				G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
																433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	C	F	S	W	T	D	A	I	D	H	G	P	Q	M	T	A	I	R	D	G	V	R	G	K	D	K	L	D	V	P	I	K	F	I	W	N	Y	A	G	N	T	L	V	N	Q	H	S	D	I	N	K	T	H	E	I	L	Q	D	E	S	K	C	E	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.												.	.	.
Template Conservation																																																														.												.	.	.
Template Sequence		P	K	Y	S	A	S	Y	I	K	S	M	W	P	D	A	D	L	N	E	A	Y	G	Y	L	P	K	G	E	D	G	K	D	Y	S	W	L	T	L	F	D	D	M	F	Q	G	K	I	K	G	F	F	A	W	G	Q	N	P	A	C	S	.	G	A	N	S	N	K	T	R	E	A	L	.	.	.	T	K	L	D	W
Template Known Secondary structure														T	T	S									S			B		T	T				S										T	T									S							.	S	S	S									.	.	.	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																														.												.	.	.
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.		.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.				.	.	.	.	.
		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.														.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	V	I	E	N	F	M	T	S	S	A	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	I	L	L	P	D	L	M	T	V	E	Q	E	D	I	I	P	N	D	Y	A	G	N	M	G	Y	L	I	F	L	Q	P	V	T	S	E	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	I	L	S	E	V	A	K
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.
Template Sequence		M	V	N	V	N	I	F	D	N	E	T	G	S	F	W	R	G	P	D	M	D	P	K	K	I	K	T	E	V	F	F	L	P	C	A	V	A	I	E	K	E	.	.	.	.	G	S	I	S	N	S	G	R	W	M	Q	W	R	Y	V	G	P	E	P	R	K	N	A	I	P	D	G	D	L	I	V	E	L	A	K
Template Known Secondary structure							S	S			T	T	T	T	G	G	G	S	T	T			G	G	G										B			G	G	G			.	.	.	.						T	T									S	S				T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.
Template SS confidence
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.					580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
		566	.	.	.																			570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.											.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	Y	Q	K	F	T	E	G	R	T	Q	E	Q	W	L	Q	H	L	Y	A	K	M	L	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	A	L	P	S	Y	D	E	L	K	K	M	G	I	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	Q	K	L	L	A	K	T	P	G	K	L	A	A	P	V	T	K	L	K	T	D	Y	W	V	N	D	H	G	H	F	D	P	H	K	I	A	K	L	I	N	G	F	A	L	K	D	F	K	V	G	D	V	E	Y	K	A	G	Q	Q	I	A	T	F	G	H	L	Q	A	D	G	S	T	T	S	G	C	W	I
Template Known Secondary structure										S		T	T								S		G	G	G	G	B		T	T	S		B												B	B	S	S					T	T					T	T		B		S		G	G	G			T	T	S		B			S	S	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		615	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.
																																	611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	K	R	K	D	P	N	G	H	F	V	A	Y	K	A	F	R	D	D	P	E	A	N	P	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	S	R	L	A	E	I	A	R	T	W	E	L	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	G	S	Y	T	E	K	G	N	M	A	A	R	R	D	K	T	Q	T	D	M	Q	A	K	I	G	L	Y	P	G	W	T	W	A	W	P	V	N	R	R	I	I	Y	N	R	A	S	V	D	L	N	G	K	P	Y	A	P	E	K	A	V	V	E	W	N	A	A	E	K	K	W	V	G	D	V	P	D	G	P
Template Known Secondary structure		G	T	T	S			T	T			G	G	G		B												T			T	T	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S		B	S		G	G	G		S					T	T	T	T					S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		695	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.
		660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	D	E	V	I	S	P	L	P	V	Y	A	S	T	F	E	G	W	N	S	P	E	R	R	T	F	P	L	Q	L	F	G	F	H	Y	K	S	R	T
Query Conservation
Alig confidence																													.
Template Conservation																													.
Template Sequence		W	P	P	Q	A	D	K	E	K	G	K	R	A	F	I	M	K	P	E	G	Y	A	Y	L	Y	G	P	.	G	R	E	D	G	P	L	P	E	Y	Y
Template Known Secondary structure		S			T	T		T	T	T				S		T	T	S	S	S	S		B		S	S		T	.	T	S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																													.
Template SS confidence
		775	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.		.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.