Job Description P77374 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:16 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 694 % Identity 28% Template c2vpyE_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: E: PDB Molecule:thiosulfate reductase; PDBTitle: polysulfide reductase with bound quinone inhibitor,2 pentachlorophenol (pcp) Resolution 2.50 Å

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		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		A	A	V	Q	Q	A	R	E	K	V	V	W	G	A	C	S	V	N	C	G	S	R	C	A	L	R	L	H	V	K	D	N	E	V	T	W	V	E	T	D	N	T	G	S	D	E	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	I	N	H	P	D	R	L	N	Y	P	M	K	R	V	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																			.																							.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation																			.																							.	.	.	.
Template Sequence		A	P	W	Y	A	Q	E	V	K	S	V	Y	Q	I	C	E	G	.	C	F	W	R	C	G	I	V	A	H	A	V	G	N	R	V	Y	K	V	E	G	Y	.	.	.	.	E	A	N	P	K	S	R	G	R	L	C	P	R	G	Q	G	A	P	Q	T	T	Y	D	P	D	R	L	K	R	P	L	I	R	V	E	G
Template Known Secondary structure				T	T	S	S											S	.	S	T	T									S	S	S									.	.	.	.	T	T	S	T	T	T	T	T									G	G	G	G	G	G		T	T	S			S						T	T
Template Predicted Secondary structure																			.																							.	.	.	.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.		.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.					.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Query SS confidence																																																																													.	.
Query Sequence		G	K	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	A	S	S	L	K	K	T	V	E	Q	Y	G	N	E	A	V	Y	I	Q	Y	S	S	G	I	V	G	G	N	M	T	R	S	S	P	S	A	S	A	V	K	R	L	M	N	C	Y	G	G	S	L	N	Q	Y	G	S	.	.	Y	S	T
Query Conservation																																																																													.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	Q	R	G	E	G	K	Y	R	V	A	T	W	E	E	A	L	D	H	I	A	K	K	M	L	E	I	R	E	K	Y	G	P	E	A	I	A	F	F	G	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	D	Y	W	F	V	D	F	L	P	A	A	W	G	S	P	N	A	A	K	P	S	V	S	L	C	T
Template Known Secondary structure				S	S	S																												G	G	G	S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T					T	T	T					T	T											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.											.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		A	Q	I	S	C	A	M	P	Y	T	Y	G	.	S	N	D	G	N	S	T	T	D	I	E	N	S	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	G	G	G	I	T	Y	L	L	E	K	A	R	E	K	S	N	A	K	M	I	V	I	D	P	R	Y	T	D	T	A	A	G	R	E	D	E	W	L
Query Conservation														.
Alig confidence														.																															.	.	.																												.
Template Conservation																																													.	.	.																												.
Template Sequence		A	P	R	E	V	A	S	Q	W	V	F	G	R	P	I	G	G	H	E	P	I	D	W	E	N	A	R	Y	I	V	L	I	G	H	H	I	G	E	D	T	H	N	T	.	.	.	Q	L	Q	D	F	A	L	A	L	K	N	G	A	K	V	V	V	V	D	P	R	F	S	T	A	A	A	.	K	A	H	R	W	L
Template Known Secondary structure												S	S	S				S	S			B		G	G	G		S						S			B	T	T	B					.	.	.											T	T								S	B			T	T	G	G	.	G		S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.																												.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.				.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	I	R	P	G	T	D	A	A	L	V	A	G	I	A	W	V	L	I	N	E	N	L	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	Y	D	E	K	T	L	P	A	D	A	P	K	N	G	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	D	D	K	T	A	K	T	P	Q	W	A	S	Q	I	T	G	I	P	E	D	R
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	K	P	G	T	D	T	A	L	L	L	A	W	I	H	V	L	I	Y	E	D	L	Y	D	K	E	Y	V	A	K	Y	T	V	G	F	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	A	H	V	K	D	F	T	P	E	W	A	E	K	H	T	E	I	P	A	Q	V
Template Known Secondary structure					T	T																T	T		S												T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T												S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.		.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.												420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	K	L	A	R	E	I	G	T	A	K	P	A	Y	I	C	Q	.	G	W	G	P	Q	R	Q	A	N	G	E	L	T	A	R	A	I	A	M	L	P	I	L	T	G	N	V	G	I	S	G	G	N	S	G	A	R	E	S	T	Y	T	I	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	L	P	V
Query Conservation																				.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	R	E	V	A	R	E	M	A	A	H	K	P	R	A	V	L	P	P	T	R	H	N	V	W	Y	G	D	D	T	Y	R	V	M	A	L	L	Y	V	N	V	L	L	G	N	Y	G	R	P	G	G	F	Y	I	A	Q	S	P	Y	L	E	K	Y	P	L	P	P	L	P	L	E	P	A	A	G	G	C	S	G	P
Template Known Secondary structure												T	T	T	S							S				S	T	T																T	T		B	T	S	T	T	S	B				B													S						S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	N	P	V	K	T	S	I	S	C	F	S	W	T	D	A	I	D	H	G	P	Q	M	T	A	I	R	D	G	V	R	G	K	D	K	L	D	V	P	I	K	F	I	W	N	Y	A	G	N	T	L	V	N	Q	H	S	D	I	N	K	T	H	E	I	L	Q	D	E	S	K	C	E	M	I	V	V	I	E	N
Query Conservation
Alig confidence																																																								.												.	.	.
Template Conservation																																																								.												.	.	.
Template Sequence		S	G	G	D	H	E	P	E	G	F	K	P	R	A	D	K	G	K	F	F	A	R	S	T	A	I	Q	E	L	I	E	P	M	I	T	G	E	P	Y	P	I	K	G	L	F	A	Y	G	I	N	L	F	H	S	.	I	P	N	V	P	R	T	K	E	A	L	.	.	.	K	N	L	D	L	Y	V	A	I	D	V
Template Known Secondary structure		S	T	T	T	T	S	S	S	S	S	S			T	T	T	T	S	S	S	S	S	S			G	G	G	T	T	S							S	S									S							.	S	S										.	.	.				S							S
Template Predicted Secondary structure																																																								.												.	.	.
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.		.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.				.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	M	T	S	S	A	K	Y	A	D	I	L	L	P	D	L	M	T	V	E	Q	E	D	I	I	P	N	D	Y	A	G	N	M	G	Y	L	I	F	L	Q	P	V	T	S	E	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	I	L	S	E	V	A	K	R	L	G	P	D	V	Y	Q	K	F	T	E	G	R	T	Q	E	Q	W
Query Conservation
Alig confidence																											.																																														.	.	.
Template Conservation																											.																																														.	.	.
Template Sequence		L	P	Q	E	H	V	M	W	A	D	V	I	L	P	E	A	T	Y	L	E	R	Y	D	D	F	.	V	L	V	A	H	K	T	P	F	I	Q	L	R	T	P	A	H	E	P	L	F	D	T	K	P	G	W	W	I	A	R	E	L	G	L	R	L	G	L	E	Q	Y	F	P	W	.	.	.	K	T	I	E	E	Y
Template Known Secondary structure		S							T	S	S					B			G	G	G						.					B	S	S									S	S				S	S		B												T	T	T		T	T	T				.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																											.																																														.	.	.
Template SS confidence
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.		.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.				.	.	540	.	.	.
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	H	L	Y	A	K	M	L	A	K	D	P	A	L	P	S	Y	D	E	L	K	K	M	G	I	Y	K	R	K	D	P	N	G	H	F	V	A	Y	K	A	F	R	D	D	P	E	A	N	P	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	S	R	L	A	E	I	A	R	T	W	E	L	E	K	D	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	T	R	L	Q	.	.	.	.	.	.	S	L	G	L	D	L	E	T	M	K	G	M	G	T	L	V	Q	R	G	K	P	.	.	.	.	.	W	L	E	D	W	E	K	E	G	R	L	P	F	G	T	A	S	G	K	I	E	L	Y	C	Q	R	F	K	E	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H
Template Known Secondary structure							T	.	.	.	.	.	.	T	T	T										S									.	.	.	.	.	S						T	T	T				S	S	S	S	S			S	S							S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		544	.	.	.	.	.							550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570						.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.											.
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.		.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.
Predicted Secondary structure																																																	.																															.	.
Query SS confidence																																																	.																															.	.
Query Sequence		S	P	L	P	V	Y	A	S	T	F	E	G	W	N	S	P	E	R	R	T	F	P	L	Q	L	F	G	F	H	Y	K	S	R	T	H	S	T	Y	G	N	I	D	L	L	K	A	A	.	C	R	Q	E	V	W	I	N	P	I	D	A	Q	K	R	G	I	A	N	G	D	M	V	R	V	F	N	H	R	G	.	.
Query Conservation																																																	.																															.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.																															.																															.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	P	L	P	V	F	T	P	P	E	E	.	.	.	.	.	.	P	P	E	G	F	Y	R	L	L	Y	G	R	S	P	V	H	T	F	A	R	T	Q	N	N	W	V	L	M	E	M	D	P	E	N	E	V	W	I	H	K	E	E	A	K	R	L	G	L	K	E	G	D	Y	V	M	L	V	N	Q	D	G	V	K
Template Known Secondary structure			S										.	.	.	.	.	.			T	T							B			T	T			G	G	G	G	T	T										S													T	T			T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.							.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
		742	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.		.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.
Query SS confidence																																																	.
Query Sequence		E	V	R	L	P	A	K	V	T	P	R	I	L	P	G	V	S	A	M	G	Q	G	A	W	H	E	A	N	M	S	G	D	K	I	D	H	G	G	C	V	N	T	L	T	T	L	R	.	P	S	P	L	A	K	G	N	P	Q	H	T	N	L	V	E	I	E	K	I
Query Conservation																																																	.
Alig confidence																																																	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	P	V	R	V	K	P	T	A	R	I	R	K	D	C	V	Y	I	V	H	G	F	G	H	K	A	P	L	M	R	L	A	H	G	R	G	A	S	D	N	Y	L	Q	T	R	Y	K	L	D	P	I	S	G	G	A	G	L	R	V	N	F	V	R	L	E	K	A
Template Known Secondary structure											S	S	B		T	T	B		B		B	T	T						T	T	S	T	T	T	T	T		S														S	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.