Job Description P77374 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:16 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 717 % Identity 24% Template c2ivfA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:ethylbenzene dehydrogenase alpha-subunit; PDBTitle: ethylbenzene dehydrogenase from aromatoleum aromaticum Resolution 1.88 Å

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		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60			.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.								.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	A	R	E	K	V	V	W	G	A	C	S	V	N	C	.	.	G	S	R	C	A	L	R	L	H	V	K	D	N	E	V	T	W	V	E	T	D	N	T	G	S	D	E	Y	G	N	H	Q	V	R	A	.	.	.	.	.	.	.	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	I	N	H	P	D	R	L	N	Y	P	M
Query Conservation																	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.																						.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.
Template Sequence		W	K	W	D	K	V	N	W	G	S	H	L	N	I	C	W	P	Q	G	S	C	K	F	Y	V	Y	V	R	N	G	I	V	W	R	E	E	Q	A	.	.	.	.	A	Q	T	P	A	C	N	V	D	Y	V	D	Y	N	P	L	G	C	Q	K	G	S	A	F	N	N	N	L	Y	G	D	E	R	V	K	Y	P	L
Template Known Secondary structure		S			S									S			S	S												T	T									.	.	.	.						S	S	T	T	S					S				T	T	G	G	G	T					T	S	T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.					110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	R	V	G	K	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	A	S	S	L	K	K	T	V	E	Q	Y	G	N	E	A	V	Y	I	Q	Y	S	S	G	I	V	G	G	N	M	T	R	S	S	P	S	A	S	A	V	K	R	L	M	N	C	Y	G	G	S	L	N	Q	Y	G	S	Y	S
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.																									.
Template Sequence		K	R	V	G	K	R	G	E	G	K	W	K	R	V	S	W	D	E	A	A	G	D	I	A	D	S	I	I	D	S	F	E	A	Q	G	S	D	G	F	I	L	D	A	P	H	V	.	.	.	.	.	.	H	A	G	S	I	A	W	G	A	G	F	R	M	T	Y	L	M	D	G	V	S	P	D	I	.	N	V	D
Template Known Secondary structure					S	S	T	T	S																											G	G	G	G								S	.	.	.	.	.	.	T	T																T		B					.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.																									.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.							.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.		.	.	220
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		T	A	Q	I	S	C	A	M	P	Y	T	Y	G	.	S	N	D	G	N	S	T	T	D	I	E	N	S	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	G	G	G	I	T	Y	L	L	E	K	A	R	E	K	S	N	A	K	M	I	V	I	D	P	R	Y	T	D	T	A	A	G	R	E	D	E	W
Query Conservation															.
Alig confidence															.																															.	.	.											.																	.
Template Conservation																																														.	.	.											.																	.
Template Sequence		I	G	D	T	Y	M	G	A	F	H	T	F	G	K	M	H	M	G	Y	S	A	D	N	L	L	D	A	E	L	I	F	M	T	C	S	N	W	S	Y	T	Y	P	S	S	.	.	.	Y	H	F	L	S	E	A	R	Y	K	.	G	A	E	V	V	V	I	A	P	D	F	N	P	T	T	P	.	A	A	D	L	H
Template Known Secondary structure			T											S					B			G	G	G	G	G	G		S						S								T	T	T	.	.	.											.	T								S	S			T	T	G	G	.	G		S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.											.																	.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.	.	.		.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290		.	.	.	.	.
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	I	R	P	G	T	D	A	A	L	V	A	G	I	A	W	V	L	I	N	E	N	L	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	Y	D	E	K	T	L	P	A	D	A	P	K	N	G	H	Y	K
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	V	R	V	G	S	D	A	A	F	W	L	G	L	S	Q	V	M	I	D	E	K	L	F	D	R	Q	F	V	C	E	Q	T	D	L	P	L	L	V	R	M	D	T	G	K	F	L	S	A	E	D	V	D	G	G	E	A	K	Q	F	Y	F	F	D	E	K	A	G	S	V	R	K	A	S	R	G	T	L	K
Template Known Secondary structure						T	T																T	T		S									B	S	T	T	S				T	T	T		S	B		B						S			T	T							T	T	T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
																										329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	I	L	G	E	G	D	D	K	T	A	K	T	P	Q	W	A	S	Q	I	T	G	I	P	E	D	R	I	I	K	L	A	R	E	I	G	T	A	K	P	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	Q	A	N	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.
Template Conservation																																																																						.
Template Sequence		L	D	F	M	P	A	L	E	G	T	F	S	A	R	L	K	N	G	K	T	I	Q	V	R	T	V	F	E	G	L	R	E	H	L	K	D	Y	T	P	E	K	A	S	A	K	C	G	V	P	V	S	L	I	R	E	L	G	R	K	V	A	K	K	R	T	C	S	Y	.	I	G	F	S	S	A	K	S	Y	H	G
Template Known Secondary structure			S	S					S								T	T	S																G	G	G	G	S																									S						.			T	T	T	T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.		.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	T	A	R	A	I	A	M	L	P	I	L	T	G	N	V	G	I	S	G	G	N	S	G	A	R	E	S	T	Y	T	I	T	I	E	R	L	P	V	L	D	N	P	V	K	T	S	I	S	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	M	E	R	S	L	F	L	A	M	A	L	S	G	N	W	G	K	P	G	T	G	A	F	A	W	A	Y	S	D	D	N	M	V	Y	L	G	V	M	S	K	P	T	A	Q	G	G	M	D	E	L	H	Q	M	A	E	G	F	N	K	R	T	L	E	A	D	P	T	S	T	D	E	M	G	N	I	E	F	M
Template Known Secondary structure															T	T		S	S	S	T	T			S		B															S	S		G	G	G	T	T	T																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.
																																						436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	W	T	D	A	I	D	H	G	P	Q	M	T	A	I	R	D	G	V	R	G	K	D	K	L	D	V	P	I	K	F	I	W	N	Y	A	G	N	T	L	V	N	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	V	T	S	A	V	G	L	V	P	P	A	M	W	L	Y	Y	H	V	G	Y	D	Q	L	W	N	N	K	A	W	T	D	P	A	L	K	K	S	F	G	A	Y	L	D	E	A	K	E	K	G	W	W	T	N	D	H	I	R	P	A	P	D	K	T	P	Q	V	Y	M	L	L	S	Q	N	P	M	R	R	K
Template Known Secondary structure								T	T												S	S	T					T		G	G	G	S		T	T	S	S	S												T	T	S	S		T	T	T	S		S		T	T	S									S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		535	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	S	D	I	N	K	T	H	E	I	L	Q	D	E	S	K	C	E	M	I	V	V	I	E	N	F	M	T	S	S	A	K	Y	A	D	I	L	L	P	D	L	M	T	V	E	Q	E	D	I	I	P	N	D	Y	A	G	N	M	G	Y	L	I	F	L	Q	P	V	T	S	E	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	I
Query Conservation
Alig confidence											.	.																																							.	.
Template Conservation											.	.																																							.	.
Template Sequence		R	S	G	A	K	M	F	P	D	.	.	V	L	F	P	K	L	K	M	I	F	A	L	E	T	R	M	S	S	S	A	M	Y	A	D	I	V	L	P	C	A	W	Y	Y	E	K	H	E	M	.	.	T	T	P	C	S	G	N	P	F	F	T	F	V	D	R	S	V	A	P	P	G	E	C	R	E	E	W	D	A
Template Known Secondary structure		T	T								.	.	T	T	G	G	G		S							S	B			T	T	G	G	G		S					B			T	T						.	.					S	S	S										S			S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure											.	.																																							.	.
Template SS confidence
		615	.	.	.	.	620	.	.	.			.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.			.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690
		560	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	E	V	A	K	R	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	V	Y	Q	K	F	T	E	G	R	T	Q	E	Q	W	L	Q	H	L	Y	A	K	M	L	A	K	D	P	A	L	P	S	Y	D	E	L	K	K	M	G	I	Y	K
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		I	A	L	I	L	K	K	V	G	E	R	A	A	A	R	G	L	T	E	F	N	D	H	N	G	R	K	R	R	Y	D	E	L	Y	K	K	F	T	M	D	G	H	L	L	T	N	E	D	C	L	K	E	M	V	D	I	N	R	A	V	.	G	V	F	A	K	D	Y	T	Y	E	K	F	K	K	E	G	Q	T	R
Template Known Secondary structure																T	T							T	T	S					G	G	G						T	T	T	T	T			S															T	.	T	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		691	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750		.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.														.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.			.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query Sequence		R	K	D	P	N	G	H	F	V	A	Y	K	A	F	R	D	D	P	E	A	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	.	.	S	S	R	L	A	E	I	A	R	T	W	E	L	E	K	D	E	V	I	S	P	L	P	V	Y	A	S	T	F	E	G	W
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template Sequence		F	L	S	M	G	T	G	V	S	R	Y	A	H	A	N	E	V	D	V	T	K	P	I	Y	P	M	R	W	H	F	D	D	K	K	V	F	P	T	H	T	R	R	A	Q	F	Y	L	D	H	D	W	Y	L	E	A	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	P	T	H	K	D	T	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S		T	T	S						T		S				T	T	S				S							S					S	S	T	T	S	S	B													T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.
Template SS confidence
		770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.												.	.	.	830	.	.	.	.
		678	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.			.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		N	S	P	E	R	R	T	F	P	L	Q	L	F	G	F	H	Y	K	S	R	T	H	S	T	Y	G	N	I	D	L	L	K	A	A	.	.	C	R	Q	E	V	W	I	N	P	I	D	A	Q	K	R	G	I	A	N	G	D	M	V	R	V	F	N	H	R	G	E	V	R	L	P	A	K	V	T	P	R	I	L	P
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence		.																																		.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	P	M	V	G	G	D	H	P	F	K	I	T	G	G	H	P	R	V	S	I	H	S	T	H	L	T	N	S	H	L	S	R	L	H	R	G	Q	P	V	V	H	M	N	S	K	D	A	A	E	L	G	I	K	D	G	D	M	A	K	L	F	N	D	F	A	D	C	E	I	M	V	R	T	A	P	N	V	Q	P
Template Known Secondary structure		.			T	T	S	S		S									S	S	S	S	T	T	T	T	T	T						T	T	S		S	S													T	T			T	T								S	S											T	T	S		T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			835	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.
		756	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.			.	.	.	.	.																.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	V	S	A	M	G	Q	G	A	W	H	E	A	N	M	S	G	D	K	I	D	H	G	G	C	V	N	T	L	T	T	L	R	P	S	P	.	.	L	A	K	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	H	T	N	L	V	E	I	E	K
Query Conservation																																						.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	C	I	V	Y	F	W	D	A	H	Q	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	G	W	K	P	Y	D	I	L	L	I	G	M	P	K	P	L	H	L	A	G	G	Y	E	Q	F	R	Y	Y	F	M	N	G	S	P	A	P	V	T	D	R	G	V	R	V	S	I	K	K
Template Known Secondary structure		T									G	G	G	S	G	.	.	.	.	.	.	.	G	G			G	G	G	G							G	G	G	G			S	B	T	T	B			B	T	T	B		S			S				B	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		914	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.								.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.