Job Description P77374 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:16 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 733 % Identity 24% Template c1kqgA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit; PDBTitle: formate dehydrogenase n from e. coli Resolution 2.80 Å

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		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.								.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	E	K	V	V	W	G	A	C	S	V	N	C	G	S	R	C	A	L	R	L	H	V	K	D	.	.	.	.	.	.	.	N	E	V	T	W	V	E	T	D	N	T	G	S	D	E	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	I	N	H	P	D	R	L	N	Y	P	M	K	R	V
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.														.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation														.																														.	.	.	.
Template Sequence		L	R	A	K	E	I	R	N	T	C	T	Y	.	C	S	V	G	C	G	L	L	M	Y	S	L	G	D	G	A	K	N	A	R	E	A	I	Y	H	I	E	G	D	.	.	.	.	P	D	H	P	V	S	R	G	A	L	C	P	K	G	A	G	L	L	D	Y	V	N	S	E	N	R	L	R	Y	P	E	Y	R	A
Template Known Secondary structure		T	T	S								S	S	.	B	T	T										S		S		T	T	S											.	.	.	.	T	T		T	T	T	T	T								T	T					T		T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure														.																														.	.	.	.
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.		.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.					.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.						.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.
Query Sequence		G	K	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	A	S	S	L	K	K	T	V	E	Q	Y	G	N	E	A	V	.	.	.	.	.	Y	I	Q	Y	S	S	G	I	V	G	G	N	M	T	R	S	S	P	S	A	S	A	V	K	R	L	M	N	C	Y	G	G	S	L	N	Q	Y	G	S
Query Conservation																																						.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.																																		.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.
Template Sequence		P	.	.	G	S	D	K	W	Q	R	I	S	W	E	E	A	F	S	R	I	A	K	L	M	K	A	D	R	D	A	N	F	I	E	K	N	E	Q	G	V	T	V	N	R	W	L	S	T	G	M	L	C	A	S	G	A	S	N	E	T	G	M	L	T	Q	K	F	A	R	S	L	G	M	L	A	V	D	N	Q	A
Template Known Secondary structure		T	.	.	T		S	S																														T	T	S						B		S							T	T	S															T	T	B						G	G
Template Predicted Secondary structure			.	.
Template SS confidence
		116			.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		Y	S	T	A	Q	I	S	C	A	M	P	Y	T	Y	G	.	S	N	D	G	N	S	T	T	D	I	E	N	S	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	G	G	G	I	T	Y	L	L	E	K	A	R	E	K	S	N	A	K	M	I	V	I	D	P	R	Y	T	D	T	A	A	G	R	E	D
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.																															.	.	.																												.
Template Conservation																																																.	.	.																												.
Template Sequence		R	V	H	G	P	T	V	A	S	L	A	P	T	F	G	R	G	A	M	T	N	H	W	V	D	I	K	N	A	N	V	V	M	V	M	G	G	N	A	A	E	A	H	P	V	G	.	.	.	F	R	W	A	M	E	A	K	N	N	N	D	A	T	L	I	V	V	D	P	R	F	T	R	T	A	S	.	V	A	D
Template Known Secondary structure		G														S			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S				.	.	.											S									S	S							.	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.																												.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.				240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	W	L	P	I	R	P	G	T	D	A	A	L	V	A	G	I	A	W	V	L	I	N	E	N	L	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	E	K	T	L	P	A	D
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	Y	A	P	I	R	S	G	T	D	I	T	F	L	S	G	V	L	R	Y	L	I	E	N	N	K	I	N	A	E	Y	V	K	H	Y	T	N	A	S	L	L	V	R	D	D	F	A	F	E	D	G	L	F	S	G	Y	D	A	E	K	R	Q	Y	D	K	S	S	W	N	Y	Q	L	D	E	N	G	Y	A	K	R
Template Known Secondary structure								T	T																T	T		S									B	S	T	T	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T					T	T	S	S	B		B		T	T	S	S	B		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.					.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	K	N	G	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	D	D	K	T	A	K	T	P	Q	W	A	S	Q	I	T	G	I	P	E	D	R	I	I	K	L	A	R	E	I	G	T	A	.	.	.	.	K	P	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	Q	A	N	G	E	L	T	A	R	A	I	A	M	L	P	I
Query Conservation																																																	.	.	.	.
Alig confidence																																																	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	T	L	T	H	P	R	C	V	W	N	L	L	K	E	H	V	S	R	Y	T	P	D	V	V	E	N	I	C	G	T	P	K	A	D	F	L	K	V	C	E	V	L	A	S	T	S	A	P	D	R	T	T	T	F	L	Y	A	L	G	W	T	Q	H	T	V	G	A	Q	N	I	R	T	M	A	M	I	Q	L
Template Known Secondary structure			T	T	S		S	T	T	B										T	T																										G	G	G	S	T	T								S					S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.												420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	G	N	V	G	I	S	G	G	N	S	G	A	R	E	S	T	Y	T	I	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	L	P	V	L	D	N	P	V	K	T	S	I	S	C	F	S	W	T	D	A	I	D	H	G	P	Q	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	G	N	M	G	M	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	H	S	N	I	Q	G	L	T	D	L	G	L	L	S	T	S	L	P	G	Y	L	T	L	P	S	E	K	Q	V	D	L	Q	S	Y	L	E	A	N	T	P	K	A	T	L	A	D	Q	V	N	Y	W	S	N	Y	P	K	F	F	V	S	L	M	K
Template Known Secondary structure			T	T		T	T	S	T	T		S							B	T	T							T	T		S	T	T			G	G	G					B	T	T			S									S				S	S	S	S				G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
																									450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	R	D	G	V	R	G	K	D	K	L	D	V	P	I	K	F	I	W	N	Y	A	G	N	T	L	V	N	Q	H	S	D	I	N	K	T	H	E	I	L	Q	D	E	S	K	C	E	M	I	V	V	I	E	N	F	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.												.	.	.
Template Conservation																																																						.												.	.	.
Template Sequence		S	F	Y	G	D	A	A	Q	K	E	N	N	W	G	Y	D	W	L	P	K	W	D	Q	T	Y	D	V	I	K	Y	F	N	M	M	D	E	G	K	V	T	G	Y	F	C	Q	G	F	N	P	V	A	S	.	F	P	D	K	N	K	V	V	S	C	L	.	.	.	S	K	L	K	Y	M	V	V	I	D	P	L	V
Template Known Secondary structure					G	G	G			G	G	G	G	G	G	G	G	G	S			B	S	S													T	T									S							.	S	S										.	.	.	T	T		S							S	B
Template Predicted Secondary structure																																																						.												.	.	.
Template SS confidence
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.		.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.				.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.
		507	.	.	510	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.
Query Sequence		T	S	S	A	K	Y	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	L	P	D	L	M	T	V	E	Q	E	D	I	I	P	N	D	Y	A	G	N	M	G	Y	L	I	F	L	Q	P	V	T	S	E	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	I	L	S	E	V	A	K	R	L	G	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.																																							.
Template Conservation																																							.	.	.	.
Template Sequence		T	E	T	S	T	F	W	Q	N	H	G	E	S	N	D	V	D	P	A	S	I	Q	T	E	V	F	R	L	P	S	T	C	F	A	E	E	D	.	.	.	.	G	S	I	A	N	S	G	R	W	L	Q	W	H	W	K	G	Q	D	A	P	G	E	A	R	N	D	G	E	I	L	A	G	I	Y	H	H	L	R	E
Template Known Secondary structure			T	G	G	G	T	T	S			G	G	G	G				G	G	G										B			G	G	G	S		.	.	.	.						T	T	S									S			S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		587	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.					.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.
																	569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.													590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	V	Y	Q	K	F	T	E	G	R	T	Q	E	Q	W	L	Q	H	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	M	L	A	K	D	P	A	L	P	S	Y	D	E	L	K	K	M	G	I	Y	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Y	Q	S	E	G	G	K	G	V	E	P	L	M	K	M	S	W	N	Y	K	Q	P	H	E	P	Q	S	D	E	V	A	K	E	N	N	G	Y	A	L	E	D	L	Y	D	A	N	G	V	L	I	A	K	K	G	Q	L	L	S	S	F	A	H	L	R	D	D	G	T	T	A	S	S	C	W	I	Y	T	G	S
Template Known Secondary structure									S	S							S					S	S	T	T	S															S	S					T	T	S						T	T		B		S		G	G	G			S	S	S	S				S		G	G	G	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		663	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
																													614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	P	N	G	H	F	V	A	Y	K	A	F	R	D	D	P	E	A	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	T	P	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	T	E	Q	G	N	Q	M	A	N	R	D	N	S	D	P	S	G	L	G	N	T	L	G	W	A	W	A	W	P	L	N	R	R	V	L	Y	N	R	A	S	A	D	I	N	G	K	P	W	D	P	K	R	M	L	I	Q	W	N	G	S	K	W	T	G	N	D	I	P	D	F	G	N	A	A	P	G	T	P	T
Template Known Secondary structure				T	T			G	G	G		B					T	T	S	S	S			T	T	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S		B	S	S	G	G	G							S	S	S				S	S			S	S		S			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		743	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.
		640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	K	I	E	I	Y	S	S	R	L	A	E	I	A	R	T	W	E	L	E	K	D	E	V	I	S	P	L	P	V	Y	A	S	T	F	E	G	W	N	S	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	T	F	P	L	Q	L	F	G	F	H	Y	K
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.
Template Sequence		G	P	F	I	M	Q	P	E	G	M	G	R	L	F	A	.	.	.	.	I	N	K	M	A	E	G	P	F	P	E	H	Y	E	P	I	E	T	P	L	G	T	N	P	L	H	P	N	V	V	S	N	P	V	V	R	L	Y	E	Q	D	A	L	R	M	G	K	K	E	Q	F	P	Y	V	G	T	T	Y	R	L	T
Template Known Secondary structure			S		T	T	S	T	T	S	S	B		S	S		.	.	.	.	T	T		S	T	T		S	S							S	S		T	T	S	S		T	T		T	T			S		T	T									T	T				T	T	T											T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.
Template SS confidence
		823	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.					.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.
		696	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.		.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.									.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	T	H	S	T	Y	G	N	I	D	L	L	K	A	A	.	C	R	Q	E	V	W	I	N	P	I	D	A	Q	K	R	G	I	A	N	G	D	M	V	R	V	F	N	H	R	G	E	V	R	L	P	A	K	V	T	P	R	I	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	S	A	M	G	Q	G	A	W	H
Query Conservation																		.																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	F	H	T	W	T	K	H	A	L	L	N	A	I	A	Q	P	E	Q	F	V	E	I	S	E	T	L	A	A	A	K	G	I	N	N	G	D	R	V	T	V	S	S	K	R	G	F	I	R	A	V	A	V	V	T	R	R	L	K	P	L	N	V	N	G	Q	Q	V	E	T	V	G	I	P	I	H	W	G	F
Template Known Secondary structure		T			T	T	T	G	G	G	S							S		S														T			T	T								T	T											T	T	S						T	T														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		899	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.
		767	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	N	M	S	G	D	K	I	D	H	G	G	C	V	N	T	L	T	T	L	R	P	S	P	L	A	K	G	N	P	Q	H	T	N	L	V	E	I	E	K
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	V	A	R	.	.	.	.	.	K	G	Y	I	A	N	T	L	T	P	N	V	G	D	A	N	S	Q	T	P	E	Y	K	A	F	L	V	N	I	E	K
Template Known Secondary structure		S	S	S	S		.	.	.	.	.					G	G	G	S			S		B		T	T	T			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		979	980	.	.	.						.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.