Job Description P77374 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:16 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 690 % Identity 18% Template c1g8jC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:arsenite oxidase; PDBTitle: crystal structure analysis of arsenite oxidase from2 alcaligenes faecalis Resolution 2.03 Å

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		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70																																										.	.	.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Query Sequence		A	V	Q	Q	A	R	E	K	V	V	W	G	A	C	S	V	N	C	G	S	R	C	A	L	R	L	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	N	E	.	.	V	T	W	V	E
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Alig confidence																		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation																		.
Template Sequence		T	L	P	P	A	N	A	Q	R	T	N	M	T	C	H	F	.	C	I	V	G	C	G	Y	H	V	Y	K	W	P	E	L	E	E	G	G	R	A	P	E	Q	N	A	L	G	L	D	F	R	K	Q	L	P	P	L	A	S	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I	M	V	V
Template Known Secondary structure						T	T									S	S	.	B	T	T											T	T					S	S	G	G	G	S	T	T					S	S				T	T	S					G	G	G							T	T	S
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.		.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.						110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.
Query Sequence		T	D	N	T	G	S	D	E	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	I	N	H	P	.	.	.	.	.	D	R	L	N	Y	P	M	K	R	V	G	K	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	A	S	S	L	K	K	T	V	E	Q	Y	G	N	E	A
Query Conservation																																.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																									.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.																																									.	.	.	.
Template Sequence		P	D	.	.	.	.	K	A	C	V	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	A	.	.	.	.	D	E	W	V	D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	S	D	G	P	Q	G
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	T	T		T	T	T	T	T				T	T	G	G	G	T	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						T	.	.	.	.	T																									T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		87	.					.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.					.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.			.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.
Query SS confidence																																							.	.
Query Sequence		V	Y	I	Q	Y	S	S	G	I	V	G	G	N	M	T	R	S	S	P	S	A	S	A	V	K	R	L	M	N	C	Y	G	G	S	L	N	Q	.	.	Y	G	S	Y	S	T	A	Q	I	S	C	A	M	P	Y	T	Y	G	S	N	D	G	N	S	T	T	D	I	E	N	S	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P
Query Conservation																																							.	.
Alig confidence									.	.	.																												.	.
Template Conservation									.	.	.
Template Sequence		V	F	F	S	C	F	D	.	.	.	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R	P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	R	E	M	G	I	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W	S	I	G	N	N	P
Template Known Secondary structure									.	.	.			S	T	T															T	T	S								S	S	S	S	S	S			T	T						T	T			S			S		T	T						S						S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.				.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.														.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.									.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	T	R	M	S	G	G	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	L	L	E	K	A	R	E	K	S	N	A	K	M	I	V	I	D	P	R	Y	T	D	T	A	A	G	R	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	L	P	I	R	P	G	T	D	A	A	L	V	A	G	I	A
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		Y	E	S	Q	T	N	Y	F	L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R	I	I	F	V	D	P	R	E	T	P	S	V	A	.	I	A	R	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T	D	T	A	L	F	N	G	L	F
Template Known Secondary structure					S							T						T	T	T	T								S	S	S													S	S							.								G	G	G								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		W	V	L	I	N	E	N	L	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	Y	D	E	K	T	L	P	A	D	A	P	K	N	G	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	D	D	K	T	A	K	T	P	Q	W	A	S	Q	I	T	G	I	P	E	D	R	I	I	K	L	A	R	E	I	G	T	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	Y	V	V	E	Q	G	W	I	D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	N	R	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S	G
Template Known Secondary structure								T		S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T																											S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
			367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	A	K	P	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	Q	A	N	G	E	L	T	A	R	A	I	A	M	L	P	I	L	T	G	N	V	G	I	S	G	G	N	S	G	A	R	E	S	T	Y	T	I	T	I	E	R	L	P	V	L	D	N	P	V	K	T	S	I	S	C	F	S	W	T	D	A	I	D	H	G
Query Conservation		.
Alig confidence		.
Template Conservation
Template Sequence		Q	A	P	R	T	M	H	A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L	L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G	H	Q	E	G	Y	T	R	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	G	K	G	R	I	M	T	W
Template Known Secondary structure		S														T	S	T	T															T	T		S	S	S	T	T								S	B		B								S		S	S											T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.						.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.		.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.																																					.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.																																					.
Query Sequence		P	Q	M	T	A	I	R	D	G	V	R	G	K	D	K	L	.	.	.	.	.	D	V	P	I	K	F	I	W	N	Y	A	G	N	T	L	V	N	Q	H	S	D	I	N	K	T	H	E	I	L	Q	D	E	S	K	C	E	.	M	I	V	V	I	E	N	F	M	T	S	S	A	K	Y	A	D	I	L	L	P	D
Query Conservation																		.	.	.	.	.																																					.
Alig confidence																		.	.	.	.	.																		.												.	.	.					.
Template Conservation																																								.												.	.	.
Template Sequence		W	G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	I	V	K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	.	E	E	M	V	D	V	I	Y	E	A	T	.	.	.	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	H	L	M	L	P	A
Template Known Secondary structure			S							S	T	T																						T	T	T				.											T	.	.	.	T	T	T									S	S		T	G	G	G	G	T		S					B
Template Predicted Secondary structure																																								.												.	.	.
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.		.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.				.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.											.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	M	T	V	E	Q	E	D	I	I	P	N	D	Y	A	G	N	M	G	Y	L	I	F	L	Q	P	V	T	S	E	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	I	L	S	E	V	A	K	R	L	G	P	D	V	Y	Q	K	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	G	R	T	Q	E	Q	W	L	Q	H	L	Y
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.
Template Sequence		A	H	P	G	E	M	N	.	.	.	.	L	T	S	M	N	G	E	R	R	I	R	L	S	E	K	F	M	D	P	P	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I	A	N	A	L	R	D	M	Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G	F
Template Known Secondary structure				B	T	T	B		.	.	.	.						T	T										S			S	T	T		B																			T	T	T								T		S				S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Template SS confidence
		531	.	.	.	.	.	.					.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
		590	.	.	.	.	.	.												.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.				.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query Sequence		A	K	M	L	A	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	L	P	S	Y	D	E	L	K	K	.	.	.	M	G	I	Y	K	R	K	D	P	N	G	H	F	V	A	Y	K	A	F	R	D	D	P	E	A	N	P	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	S	R	L	A	E	I	A	R	T
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	R	A	G	Q	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R	K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	D	E	S	K	G	L	V	G	T	E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T		T	T							T	T	G	G	G	G	G	G										G	G	G				S	S			B			T	T	T			B			S		S		T	T	S			S	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
		656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.			.	.	.	.	.	.	.	710	.		.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.										.
Query SS confidence																																																	.	.										.
Query Sequence		W	E	L	E	K	D	E	V	I	S	P	L	P	V	Y	A	S	T	F	E	G	W	N	S	P	E	R	R	T	F	P	L	Q	L	F	G	F	H	Y	K	S	R	T	H	S	T	Y	.	.	G	N	I	D	L	L	K	A	A	.	C	R	Q	E	V	W	I	N	P	I	D	A	Q	K	R	G	I	A	N	G	D
Query Conservation																																																	.	.										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	P	W	N	G	L	P	A	T	V	Q	Q	Q	K	D	K	Y	R	F	W	L	N	N	G	R	N	N	E	V	W	Q	T	A	Y	H	D	Q	Y	N	S	L	M	Q	E	R	Y	P	M	A	Y	I	E	M	N	P	D	D	C	K	Q	L	D	V	T	G	G	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S												S									S	S			T	T		T	T	G	G	G									S	S														T			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.
		733	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	V	R	V	F	N	H	R	G	E	V	R	L	P	A	K	V	T	P	R	I	L	P	G	V	S	A	M	G	Q	G	A	W	H	E	A	N	M	S	G	D	K	I	D	H	G	G	C	V	N	T	L	T	T	L	R	P	S	P	L	A	K	G	N	P	Q	H	T	N	L	V	E	I	E	K	I
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Sequence		I	V	E	V	Y	N	D	F	G	S	T	F	A	M	V	Y	P	V	A	E	I	K	R	G	Q	T	F	M	L	F	G	Y	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	I	Q	G	D	V	T	T	D	W	T	D	R	D	I	.	I	P	Y	Y	K	G	T	W	G	D	I	R	K	V
Template Known Secondary structure								T	T											T	T	S		T	T							S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		G	G	G	G			S		B		T	T		.		B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template SS confidence
		745	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.													.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.		.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.