Job Description P08956 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:01:43 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 670 % Identity 16% Template c2w00B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:hsdr; PDBTitle: crystal structure of the hsdr subunit of the ecor124i2 restriction enzyme in complex with atp Resolution 2.6 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	T	Q	A	E	V	E	A	Q	Q	Q	K	L	V	A	L	N	G	Y	I	A	I	L	E	G	K	Q	Q	E	T	E	A	Q	T	Q	A	R	L	A	A	L	E	A	Q	L	A	E	K	N	A	E	L	A	K	Q	T	E	Q	E	R	K	A	Y	H	K	E	I	T	D	Q	A	I	K	R	T	L	N	L	S	E
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	S	E	S	D	L	E	R	E	L	I	Q	D	L	R	N	Q	G	Y	E	F	I	S	V	K	S	Q	S	A	X	L	A	N	V	R	E	Q	L	Q	N	L	N	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	N	D	S	E	W	R	R	F	T	E	Q	Y	L	D	N	P	S	D	G	I	L
Template Known Secondary structure		S	S															T	T								S																	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.														.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.		.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure								.
Query SS confidence								.
Query Sequence		E	E	S	R	F	L	.	I	D	A	Q	L	R	K	A	G	W	Q	A	D	S	K	T	L	R	F	S	K	G	A	R	P	E	P	G	V	N	K	A	I	A	E	W	P	T	G	K	D	E	T	G	N	Q	G	F	A	D	Y	V	L	F	V	G	L	K	P	I	A	V	V	E	A	K	R	N	N	I	D	V	P
Query Conservation								.
Alig confidence								.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	K	T	R	K	I	H	I	D	Y	I	C	D	F	I	F	D	D	E	R	L	E	N	I	Y	L	I	D	K	K	N	L	X	R	N	K	V	Q	I	I	Q	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	R	Y	D	V	T	I	L	V	N	G	L	P	L	V	Q	I	E	L	K	K	R	G	V	A	I	R
Template Known Secondary structure									T									T	T								S	S		S	S	S	G	G	G	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T											T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140										.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	L	N	E	S	Y	R	Y	S	K	C	F	D	N	G	F	L	R	E	T	L	L	E	H	Y	S	P	D	E	V	H	E	A	V	P	E	Y	E	T	S	W	Q	D	T	S	G	K	Q	R	F	K	I	P	F	C	Y	S	T	N	G	R	E	Y	R	A	T	M	K	T	K	S	G	I	W	Y	R	D	V	R
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	F	N	Q	I	H	E	N	.	.	.	.	.	S	L	F	K	Y	L	Q	L	F	V	I	S	N	G	T	D	T	R	Y	F	A	N	T	T	K	R	D	K	N	S	F	D	F	T	X	N	W	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	D	N	T
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	G	G	G	G	G									S	S									S		G	G	G		S	G	G	G		B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.						.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.																								.	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.										.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	R	N	M	S	K	A	L	P	E	W	H	R	P	E	E	L	L	E	M	L	G	S	E	P	Q	K	Q	N	Q	W	F	A	D	N	P	G	M	S	E	L	G	L	R	Y	Y	Q	E	D	A	V	R	A	V	E	K	A	I	V	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	E	I	L	L	A	M	A
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	K	D	L	K	D	F	T	A	T	C	F	Q	K	H	T	L	L	N	V	L	V	N	Y	S	V	F	D	S	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	T	L	L	V	X	R	P	Y	Q	I	A	A	T	E	R	I	L	W	K	I	K	S	S	F	T	A	K	N	W	S	K	P	E	S	G	G	Y	I	W	H	T
Template Known Secondary structure					S								T	T	S										T	S					T	T		.	.	.	.	.	.	.																										T	T			S	S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.								.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	T	G	K	T	R	T	A	I	A	M	M	F	R	L	I	Q	S	Q	R	F	K	R	I	L	F	L	V	D	R	R	S	L	G	E	Q	A	L	G	A	F	E	D	T	R	I	N	G	D	T	F	N	S	I	F	D	I	K	G	L	T	D	K	F	P	E	D	S	T	K	I	H	V	A	T	V	Q	S	L
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.
Template Conservation																																																	.	.
Template Sequence		T	G	S	G	K	T	L	T	S	F	K	A	A	R	L	A	T	E	L	D	F	I	D	K	V	F	F	V	V	D	R	K	D	L	D	Y	Q	T	X	K	E	Y	Q	R	F	S	P	.	.	D	S	V	N	G	S	E	N	T	A	G	L	K	R	N	L	D	K	D	D	N	K	I	I	V	T	T	I	Q	K	L
Template Known Secondary structure		T	T	S	S													T	T		T	T										G	G	G											T	T	S	T	.	.	T		S	S	S	S													S	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.			.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		553	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610		.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	K	R	T	L	Q	S	D	E	P	M	P	V	A	R	Y	D	C	I	V	V	D	E	A	H	R	G	Y	I	L	D	K	E	Q	T	E	G	E	L	Q	F	R	S	Q	L	D	Y	V	S	A	Y	R	R	I	L	D	H	F	.	D	A	V	K	I	A	L	T	A	T	P	A	L	H	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																												.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	N	L	X	K	A	E	S	D	L	P	V	Y	N	Q	Q	V	V	F	I	F	D	E	C	H	R	S	Q	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	Q	K	N	L	K	K	K	F	K	R	Y	Y	Q	F	G	F	T	G	T	P	I	F	P	E	N	A	L	G	S	E
Template Known Secondary structure												G	G	G	G	S								S			T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											S									S	S				S	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
			625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	T	V	Q	I	F	G	E	P	V	Y	R	Y	T	Y	R	T	A	V	I	D	G	F	L	I	D	Q	D	P	P	I	Q	I	I	T	R	N	A	Q	E	G	V	Y	L	S	K	G	E	Q	V	E	R	I	S	P	Q	G	E	V	I	N	D	T	L	E	D	D	Q	D	F	E	V	A	D	F	N	R	G	L	V
Query Conservation		.
Alig confidence		.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	A	S	V	F	G	R	E	L	H	S	Y	V	I	T	D	A	I	R	D	E	K	V	L	K	F	K	V	D	Y	N	D	V	R	P	Q	F	K	S	L	E	T	E	T	D	E	K	K	L	S	A	A	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	A	F	L
Template Known Secondary structure									S														T	S	S												T	T	T					T										T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.																					.	.	.	.	.
		704	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.									.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		I	P	A	F	N	R	A	V	C	N	E	L	T	N	Y	L	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	S	Q	K	T	L	V	F	C	V	T	N	A	H	A	D	M	V	V	E	E	L	R	A	A	F	K	K	K	Y	P	Q	L	E	H	D	A	I	I	K	I	T	G	D	A	D	K	D	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	P	X	R	I	Q	E	I	T	Q	Y	I	L	N	N	F	R	Q	K	T	H	R	T	F	P	G	S	K	G	F	N	A	X	L	A	V	S	S	V	D	A	A	K	A	Y	Y	A	T	F	K	R	L	Q	E	E	A	A	N	K	S	A	T	Y	K	P	L	R	I	A	T	I	F	S	F	A	A	I	G	E	I
Template Known Secondary structure																						T			S	S	S											S	S																						S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
																																										771	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	K	V	Q	T	M	I	T	R	F	N	K	E	R	L	P	N	I	V	V	T	V	D	L	L	T	T	G	V	D	I	P	S	I	C	N	I	V	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																																																									.
Template Sequence		S	D	E	T	F	D	T	S	A	X	D	S	S	A	K	E	F	L	D	A	A	I	R	E	Y	N	S	H	F	K	T	N	F	S	T	D	S	N	G	F	Q	N	Y	Y	R	D	L	A	Q	R	V	K	N	Q	D	.	I	D	L	L	I	V	V	G	X	F	L	T	G	F	D	A	P	T	L	N	T	L	F	V
Template Known Secondary structure						S		G	G	G	S																				T					S	S																	T	T	S	.	S	S					S	S	T	T	S	S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																									.
Template SS confidence
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
		811	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	K	V	R	S	R	I	L	Y	E	Q	M	K	G	R	A	T	R	L	C	P	E	V	N	K	T	S	F	K	I	F	D	C	V	D	I	Y	S	T	L	E	S	V	D	T	M	R	P	V	V	V	R	P	K	V	E	L	Q	T	L	V	N	E	I	T	D	S	E	T	Y	K	I	T	E	A	D	G	R	S
Query Conservation
Alig confidence											.														.
Template Conservation											.														.
Template Sequence		D	K	N	L	R	Y	H	G	L	.	X	Q	A	F	S	R	T	N	R	I	Y	D	A	.	T	K	T	F	G	N	I	V	T	F	R	D	L	E	R	S	T	I	D	A	I	T	L	F	G	D	K	N	T	K	N	V	V	L	E	K	S	Y	T	E	Y	X	E	G	F	T	D	A	A	T	G	E	A	K	R	G
Template Known Secondary structure			S								.					G	G	G						T	.	T			S						S	S													T	S		S	S						B														T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.														.
Template SS confidence
		674	.	.	.	.	.	680	.	.		.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.		.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.
		891	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	E	H	S	H	E	Q	L	V	A	K	L	Q	R	I	I	G	L	A	T	F	N	R	D	R	S	E	T	I	D	K	Q	V	R	R	L	D	E	L	C	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	X	T	V	V	S	E	L	E	Q	R	F	P	D	P	T	S	I	E	S	E	K	E	K	K	D	F	V	K	L	F	G	E	Y	L	R	A	E	N	I	L	Q
Template Known Secondary structure																S	S	S	S		S																						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		752	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.