Job Description P69434 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:11:38 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 412 % Identity 10% Template d2ooea1 SCOP info alpha-alpha superhelix TPR-like HAT/Suf repeat Resolution 3.00

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		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	Y	R	H	Q	Q	L	P	A	R	G	Y	A	A	V	A	V	A	Y	R	N	L	Q	Q	W	Q	N	S	L	T	L	W	Q	K	A	L	S	L	E	P	Q	N	K	D	Y	Q	R	G	Q	I	L	T	L	A	D	A	G	H	Y	D	T	A	L	V	K	L	K	Q	L	N	S	G	A	P	D	K	A	N	L
Query Conservation
Alig confidence																				.
Template Conservation																				.
Template Sequence		K	K	L	E	E	N	P	Y	D	L	D	A	W	S	I	L	I	R	.	E	A	Q	N	Q	P	I	D	K	A	R	K	T	Y	E	R	L	V	A	Q	F	P	S	S	G	R	F	W	K	L	Y	I	E	A	E	I	K	A	K	N	Y	D	K	V	E	K	L	F	Q	R	C	L	M	K	V	L	H	I	D	L	W
Template Known Secondary structure								T	T											.				S	S														T	T		T	T															T	T													T	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
		169		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.								.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.											.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure			.																														.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.																														.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	.	A	E	A	Y	I	Y	K	L	A	G	R	H	Q	D	E	L	R	A	M	T	E	S	L	P	E	N	A	S	T	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	Y	P	T	E	Y	V	Q	A	L	R	N	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	A	A	I	D	D	A	N	L	T	P	D	I	R	A	D
Query Conservation			.																														.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																														.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	C	Y	L	S	Y	V	R	E	T	K	G	K	L	P	S	Y	K	E	K	M	A	Q	A	Y	D	F	A	L	D	K	I	G	M	E	I	M	S	Y	Q	I	W	V	D	Y	I	N	F	L	K	G	V	E	A	V	G	S	Y	A	E	N	Q	R	I	T	A	V	R	R	V	Y	Q	R	G	C	V	N	P	M	I
Template Known Secondary structure												T	T	T	S	T	T																T	T	T	S	T	T															S				S	S	T	T																T	T	S			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	H	A	E	L	V	R	L	S	F	M	P	T	R	S	E	S	E	R	Y	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	I	E	Q	L	W	R	D	Y	N	K	Y	E	E	G	I	N	I	H	L	A	K	K	M	I	E	D	R	S	R	D	Y	M	N	A	R	R	V	A	K	E	Y	E	T	V	M	K	G	L	D	R	N	A	P	S	V	P	P	Q	P	Q	E	A	Q	Q	V	D	M	W	K	K	Y	I	Q	W	E	K	S	N	P
Template Known Secondary structure		T																										T	T																							S	S	S																											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
																		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	R	A	L	A	Q	Y	A	A	L	E	I	L	W	H	D	N	P	D	R	T	A	Q	Y	Q	R	I	Q	V	D	H	L	G	A	L	L	T	R	D	R	Y	K	D	V	I	S	H	Y	Q	R	L	K	K	T	G	Q	I	I	P	P	W	G	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	T	E	D	Q	T	L	I	T	K	R	V	M	F	A	Y	E	Q	C	L	L	V	L	G	H	H	P	D	I	W	Y	E	A	A	Q	Y	L	E	Q	S	S	K	L	L	A	E	K	G	D	M	N	N	A	K	L	F	S	D	E	A	A	N	I	Y	E	R	A	I	S	T	L	L	K	K	N	M	L	L	Y
Template Known Secondary structure		S			S		S																			T	T																					T	T	T																				T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	V	A	S	A	Y	L	K	D	H	Q	P	K	K	A	Q	S	I	M	T	E	L	F	Y	H	K	E	T	I	A	P	D	L	S	D	E	E	L	A	D	L	F	Y	S	H	L	E	S	E	N	Y	P	G	A	L	T	V	T	Q	H	T	I	N	T	S	P	P	F	L	R	L	M	G	T	P	T	S	I	P
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	Y	A	D	Y	E	E	S	R	M	K	Y	E	K	V	H	S	I	Y	N	R	L	L	A	I	E	D	.	.	.	.	I	D	P	T	L	V	Y	I	Q	Y	M	K	F	A	R	R	A	E	G	I	K	S	G	R	M	I	F	K	K	A	R	E	D	A	R	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T															S	S	S	.	.	.	.	S																															T		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.					.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410		.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.					.	470	.
Predicted Secondary structure																.																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																.																																																											.	.	.	.
Query Sequence		N	D	T	W	L	Q	G	H	S	F	L	S	T	V	.	A	K	Y	S	N	D	L	P	Q	A	E	M	T	A	R	E	L	A	Y	N	A	P	G	N	Q	G	L	R	I	D	Y	A	S	V	L	Q	A	R	G	W	P	R	A	A	E	N	E	L	K	K	A	E	V	I	E	P	R	N	.	.	.	.	I	N	L
Query Conservation																.																																																											.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.											.																																																											.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	H	H	V	Y	V	T	A	A	L	M	E	Y	Y	C	S	K	D	K	S	V	A	F	K	I	F	E	L	G	L	K	K	Y	G	D	I	P	E	Y	V	L	A	Y	I	D	Y	L	S	H	L	N	E	D	N	N	T	R	V	L	F	E	R	V	L	T	S	G	S	L	P	P	E	K	S	G	E	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	T														T																		T	T													T	T	T	T															S			S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	E	Q	A	W	T	A	L	T	L	Q	E	W	Q	Q	A	A	V	L	T	H	D	V	V	E	R	E	P	Q	D	P	G	V	V	R	L	K	R	A	V	D	V	H	N	L	A	E	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	A	R	F	L	A	F	E	S	N	I	G	D	L	A	S	I	L	K	V	E	K	R	R	F	T	A	F	R	E	E	Y	E	G	K	E	T	A	L	L	V	D	R	Y	K	F	M	D	L
Template Known Secondary structure												S	S																T					T	T							G	G	G	T		B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.