Job Description P0A9U3 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:11:24 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 432 % Identity 28% Template c2vf7B_ PDB info PDB header:dna-binding protein Chain: B: PDB Molecule:excinuclease abc, subunit a.; PDBTitle: crystal structure of uvra2 from deinococcus radiodurans Resolution 2.30 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	N	I	S	V	K	F	G	G	G	N	R	Y	G	L	I	G	A	N	G	S	G	K	S	T	F	M	.	K	I	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	D	I	S	V	K	V	P	R	D	A	L	V	V	F	T	G	V	S	G	S	G	K	S	S	L	A	F	G	T	L	Y	A	E	A	Q	R	R	Y	L	E	S	V	S	P	Y	A	R	R	L	F	N	Q	A	G	V	P	D	V	D	A	I	D	G	L	P	P	A	V	A	L	Q	Q	A	R	G	T	P	T
Template Known Secondary structure				S							S	S	S								T	T	S	S						T	T	T														S	T	T	T	T	S	S	S	T	T	S						S				S							S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	S	S	V	G	S	V	T	T	L	S	N	L	L	R	M	L	Y	S	R	A	G	D	Y	P	P	G	Q	G	I	V	Y	A	E	G	F	S	P	N	T	P	E	G	A	C	P	E	C	H	G	L	G	R	V	Y	T	V	T	E	D	S	M	V	P	D	P	S	L	T	I	R	E	R	A	V	A	A	W	P
Template Known Secondary structure					B					T	S												S	S	B			T	T						G	G	G	G		T	T	S	T	T	T	B		T	T	T	T	T	S	S												S		T	T	S	B	T	T	T	T	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	A	W	G	G	Q	N	Q	R	D	I	L	V	T	L	G	I	D	V	D	V	P	W	R	E	L	P	E	E	T	R	H	W	I	L	F	T	D	E	Q	P	V	V	P	V	Y	P	G	L	T	P	A	E	T	Q	R	A	L	K	K	K	M	E	P	S	Y	M	G	T	F	S	S	A	R	R	H	V	L	H	T
Template Known Secondary structure		S	S														T			T	T	S	B	G	G	G	S																					T	T												T	T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
																													49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	E	P	T	L	G	N	V	S	L	D	P	N	E	R	I	G	K	L	R	Q	D	Q	F	A	F	E	E	F	T	V	L	D	T	V	I	M	G	H	K	E	L	W	E	V	K	Q	E	R	D	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	N	T	E	S	A	S	M	K	K	R	V	Q	G	Y	M	I	S	E	E	C	P	L	C	H	G	K	R	L	R	Q	E	A	L	N	V	T	F	A	G	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	E	L	S	R	L	P	L	A	R	V	S	E	L	L	R	P
Template Known Secondary structure																T	T							T	T	T	T	T	S		B						T		B	B	T	T	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.			.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Query SS confidence																																																																												.	.
Query Sequence		I	Y	A	L	P	E	M	S	E	E	D	G	Y	K	V	A	D	L	E	V	K	Y	G	E	M	D	G	Y	S	A	E	A	R	A	G	E	L	L	L	G	V	G	I	P	V	E	Q	H	Y	G	P	M	S	E	V	A	P	G	W	K	L	R	V	L	L	A	Q	A	L	F	A	D	P	D	.	.	I	L	L	L
Query Conservation																																																																												.	.
Alig confidence																																				.																																								.	.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		Y	A	E	E	R	E	P	G	H	A	E	R	V	K	N	R	P	E	Q	A	I	A	L	Q	R	M	A	A	D	L	V	K	R	L	.	D	V	L	L	H	L	G	L	G	Y	L	G	L	D	R	S	T	P	T	L	S	P	G	E	L	Q	R	L	R	L	A	T	Q	L	Y	S	N	L	F	G	V	V	Y	V	L
Template Known Secondary structure					T		S	T	T																											.						T	T		T	T	S	B	S	S		B	G	G	G	S														T	T	S				S
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200				.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.							.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure																							.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	P	T	N	N	L	D	I	D	T	I	R	W	L	E	Q	V	L	N	E	.	.	.	R	D	S	T	M	I	I	I	S	H	D	R	H	F	L	N	M	V	C	T	H	M	A	D	L	.	.	.	.	.	.	D	Y	G	E	L	R	V	Y	P	G	N	Y	D	E	Y	M	T	A	A	T	Q	A	R	E	R
Query Conservation																							.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.																	.									.	.	.	.	.	.						.
Template Conservation																																										.																				.
Template Sequence		D	E	P	S	A	G	L	H	P	A	D	T	E	A	L	L	S	A	L	E	N	L	K	R	G	G	N	S	L	F	V	V	E	H	D	L	D	V	I	R	.	R	A	D	W	L	V	D	V	G	P	E	A	G	E	K	G	G	E	I	.	L	Y	S	G	P	P	E	G	L	K	H	V	P	E	S	Q	T	G	Q
Template Known Secondary structure				T	T	T	T			T	T	S													T	T	T															.			S							S	S	S	G	G	G			S		.						G	G	G	G	G	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.																				.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.		.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.		.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	A	D	N	A	K	K	K	A	Q	I	A	E	L	Q	S	F	V	S	R	F	S	A	N	A	S	K	S	R	Q	A	T	S	R	A	R	Q	I	D	K	I	K	L	E	E	V	K	A	S	S	R	Q	N	P	F	I	R	F	E	Q	D	K	K	L	F	R	N	A	L	E	V	E	G	L	T	K	G	F	D
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	F	A	D	R	H	T	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	P	R	E	P	A	G	W	L	E	L	N	G	V	T	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S										.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template SS confidence
		484	.	.	.	.	.	490	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.						.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.			.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	G	P	L	F	K	N	L	N	L	L	L	E	V	G	E	K	L	A	V	L	G	T	N	G	V	G	K	S	T	L	L	K	.	.	.	.	.	T	L	V	G	D	L	Q	P	D	S	G	T	V	K	W	S	E	N	.	.	A	R	I	G	Y	Y	A	Q	D	H	E	Y	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																			.	.	.	.	.																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																	.	.	.	.	.																			.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	R	N	N	L	D	N	L	D	V	R	F	P	L	G	V	M	T	S	V	T	G	V	S	G	S	G	K	S	T	L	V	S	Q	A	L	V	D	A	L	A	A	H	F	G	Q	G	S	A	R	L	G	G	D	L	A	Q	I	T	R	L	V	R	V	D	Q	K	P	I	G	R	T	P	R	S	N	M	A	T	Y
Template Known Secondary structure		.		T	T											S	S							S	T	T	S	S						T	T										S									S	S	G	G	G									S	S		S		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																																																396	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	L	F	D	Q	V	R	K	L	F	A	A	T	P	L	A	K	K	R	G	Y	N	A	G	R	F	S	F	N	V	K	G	G	R	C	E	H	C	Q	G	E	G	W	V	M	V	P	S	V	Y	A	P	C	P	V	C	H	G	T	R	Y	N	A	E	T	L	E	V	E	Y	R	G	K	N	I	A	D	V	L
Template Known Secondary structure			T	T								T	T	S	S	T					S				T	T	S	S		S	S	S	S	S	S	B		S	S	S	T	T														T	T	T	S	S	S		B		T	T	G	G	G			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.				.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.
Query Sequence		D	L	T	V	F	E	W	M	S	Q	W	K	Q	E	G	D	D	E	Q	A	V	R	S	I	L	G	R	L	L	F	S	Q	D	D	I	K	K	P	A	K	V	L	S	G	G	E	K	G	R	M	L	F	G	K	L	M	M	Q	K	P	N	.	.	.	I	L	I	M	D	E	P	T	N	H	L	D	M	E	S	I
Query Conservation																																																															.	.	.
Alig confidence																.																																															.	.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		A	L	T	V	D	E	A	H	D	F	F	A	D	E	.	S	A	I	F	R	A	L	D	T	L	R	E	V	G	L	G	Y	L	R	L	G	Q	P	A	T	E	L	S	G	G	E	A	Q	R	I	K	L	A	T	E	L	R	R	S	G	R	G	G	T	V	Y	V	L	D	E	P	T	T	G	L	H	P	A	D	V
Template Known Secondary structure		T		B								T	T	T		.														T		T	T	S	B	T	T			G	G	G			S															S	S	S	S									S		S	S
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		691	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.		.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.				.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.							.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	S	L	N	M	A	L	E	L	Y	.	.	.	Q	G	T	L	I	F	V	S	H	D	R	E	F	V	S	S	L	A	T	R	I	L	E	I	.	.	.	.	.	.	T	P	E	R	V	I	D	F	S	G	N	Y	E	D	Y	L	R	S	K	G
Query Conservation												.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.															.										.	.	.	.	.	.								.
Template Conservation																													.																							.
Template Sequence		E	R	L	Q	R	Q	L	V	K	L	V	D	A	G	N	T	V	I	A	V	E	H	K	M	Q	V	V	.	A	A	S	D	W	V	L	D	I	G	P	G	A	G	E	D	G	G	R	L	V	A	.	Q	G	T	P	A	E	V	A	Q	A	A	G
Template Known Secondary structure														T	T														.	T	T		S							S	S	S	G	G	G			S				.			S						T		S	S
Template Predicted Secondary structure																													.																							.
Template SS confidence
		770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.		.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.		.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830