Job Description P02921 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 10:57:37 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 411 % Identity 12% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	I	S	M	T	T	K	L	S	Y	G	F	G	A	F	G	K	D	F	A	I	G	I	V	Y	M	Y	L	M	Y	Y	Y	T	D	V	V	G	L	S	V	G	L	V	G	T	L	F	L	V	A	R	I	W	D	A	I	N	D	P	I	M	G	W	I	V	N	A	T	R	S	R	W	G	K	F	K	P	W	I	L
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	.	.	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	D	R	S	N	.	.	.	.	.	P	R	V	F	L	P
Template Known Secondary structure																							T	S								T	.	.	T	S	S	T	T		S	S																											S		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.						.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	T	L	A	N	S	V	I	L	F	L	L	F	S	A	H	L	F	E	G	T	T	Q	I	V	F	V	C	V	T	Y	I	L	W	G	M	T	Y	T	I	M	D	I	P	F	W	S	L	V	P	T	I	T	L	D	K	R	E	R	E	Q	L	V	P	Y	P	R	F	F	A	S	L	A	G	F	V	T	A	G
Query Conservation
Alig confidence																							.	.																																	.
Template Conservation																							.	.																																	.
Template Sequence		A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	.	.	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	.	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V	G	G	G	I	P	P	L
Template Known Secondary structure																						S	.	.	S	S	S																T										T	T		T	.	T	T																		T	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.																																	.
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.			.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150		.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	L	P	F	V	N	Y	V	G	G	G	D	R	G	F	G	F	Q	M	F	T	L	V	L	I	A	F	F	I	V	S	T	I	I	T	L	R	N	V	H	E	V	F	S	S	D	N	Q	P	S	A	E	G	S	H	L	T	L	K	A	I	V	A	L	I	Y	K	N	D	Q	L	S	C	L	L	G	M	A	L
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.
Template Conservation																																.	.	.
Template Sequence		L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	.	.	.	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F
Template Known Secondary structure										T			S	T	T		T															.	.	.							S	S	T	T	T				S		T	T	T						T							T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.				.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Y	N	V	A	S	N	I	I	T	G	F	A	I	Y	Y	F	S	Y	V	I	G	D	A	D	L	F	P	Y	Y	L	S	Y	A	G	A	A	N	L	V	T	L	V	F	F	P	R	L	V	K	S	L	S	R	R	I	L	W	A	G	A	S	I	L	P	V	L	S	C	G	V	L	L	L	M	A	L	M	S	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A
Template Known Secondary structure																	B	T	T	B	S																																T	S	T	T																				T	T	S			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure																																																											.
Query SS confidence																																																											.
Query Sequence		H	N	V	V	L	I	V	I	A	G	I	L	L	N	V	G	T	A	L	F	W	V	L	Q	V	I	M	V	A	D	I	V	D	Y	G	E	Y	K	L	H	V	R	C	E	S	I	A	Y	S	V	Q	T	M	V	V	K	G	.	G	S	A	F	A	A	F	F	I	A	V	V	L	G	M	I	G	Y	V	P	N	V
Query Conservation																																																											.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.																.																				.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Sequence		G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	.	.	.	.	.	.	.	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	W	D	.	.	.
Template Known Secondary structure		T																	T													T	S		T	T	.	.	.	.	.	.	.																															S	S		S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.								380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	S	T	Q	A	L	L	G	M	Q	F	I	M	I	A	L	P	T	L	F	F	M	V	T	L	I	L	Y	F	R	F	Y	R	L	N	G	D	T	L	R	R	I	Q	I	H	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.