Job Description P02921 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 10:57:37 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 412 % Identity 12% Template d1pv7a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter LacY-like proton/sugar symporter Resolution 3.60

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	S	M	T	T	K	L	S	Y	G	F	G	A	F	G	K	D	F	A	I	G	I	V	Y	M	Y	L	M	Y	Y	Y	T	D	V	V	G	L	S	V	G	L	V	G	T	L	F	L	V	A	R	I	W	D	A	I	N	D	P	I	M	G	W	I	V	N	A	T	R	S	R	W	G	K	F	K	P	W	I	L	I
Query Conservation
Alig confidence																																																																						.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	N	T	N	F	W	M	F	G	L	F	F	F	F	Y	F	F	I	M	G	A	Y	F	P	F	F	P	I	W	L	H	D	I	N	H	I	S	K	S	D	T	G	I	I	F	A	A	I	S	L	F	S	L	L	F	Q	P	L	F	G	L	L	S	D	K	L	G	.	.	.	.	.	L	R	K	Y	L	L	W
Template Known Secondary structure				S																																																					T												T	.	.	.	.	.	T		T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.						.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	L	A	N	S	V	I	L	F	L	L	F	S	A	H	L	F	E	G	T	T	Q	I	V	F	V	C	V	T	Y	I	L	W	G	M	T	Y	T	I	M	D	I	P	F	W	S	L	V	P	T	I	T	L	D	K	R	E	R	E	Q	L	V	P	Y	P	R	F	F	A	S	L	A	G	F	V	T	A	G	V
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.
Template Sequence		I	I	T	G	M	L	V	M	F	A	P	F	F	I	F	I	F	G	P	L	L	Q	Y	N	I	L	V	G	S	I	V	G	G	I	Y	L	G	F	C	F	N	A	G	A	P	A	V	E	A	F	I	E	.	.	.	K	V	S	R	R	S	N	F	E	F	G	R	A	R	M	F	G	C	V	G	W	A	L	G	A
Template Known Secondary structure									T								T							T	T								T	T	T	T	G	G	G	G	G	T	T											.	.	.							S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130				.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	P	F	V	N	Y	V	G	G	G	D	R	G	F	G	F	Q	M	F	T	L	V	L	I	A	F	F	I	V	S	T	I	I	T	L	R	N	V	H	E	V	F	S	S	D	N	Q	P	S	A	E	G	S	H	L	T	L	K	A	I	V	A	L	I	Y	K	N	D	Q	L	S	C	L	L	G	M	A	L	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	I	V	G	I	M	F	T	I	N	N	Q	F	V	F	W	L	G	S	G	C	A	L	I	L	A	V	L	L	F	F	A	K	T	D	A	P	S	S	A	T	V	A	N	A	V	G	A	N	H	S	A	F	S	L	K	L	A	L	E	L	F	R	Q	P	K	L	W	F	L	S	L	Y	V	I	G	V	S	C	T
Template Known Secondary structure																																S	S				S		S	S	S		S	S					S														T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	N	V	A	S	N	I	I	T	G	F	A	I	Y	Y	F	S	Y	V	I	G	D	A	D	L	F	P	Y	Y	L	S	Y	A	G	A	A	N	L	V	T	L	V	F	F	P	R	L	V	K	S	L	S	R	R	I	L	W	A	G	A	S	I	L	P	V	L	S	C	G	V	L	L	L	M	A	L	M	S	Y	H
Query Conservation
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	V	F	D	Q	Q	F	A	N	F	F	T	S	F	F	A	T	G	E	Q	G	T	R	V	F	G	Y	V	T	T	M	G	E	L	L	N	A	S	I	M	F	F	A	P	L	I	I	N	R	I	G	G	K	N	A	L	L	L	A	G	T	I	M	S	V	R	I	I	G	S	S	F	.	.	.	.	.	A	T
Template Known Secondary structure														T	T	S	S	S																									T	T																														T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.						.	310
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		N	V	V	L	I	V	I	A	G	I	L	L	N	V	G	T	A	L	F	W	V	L	Q	V	I	M	V	A	D	I	V	D	Y	G	E	Y	K	L	H	V	R	C	E	S	I	A	Y	S	V	.	Q	T	M	V	V	K	G	G	S	A	F	A	A	F	F	I	A	V	V	L	G	M	I	G	Y	V	P	N	V	E
Query Conservation																																																			.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.									.																											.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Template Sequence		S	A	L	E	V	V	I	L	K	T	L	H	M	F	E	V	P	F	L	L	V	G	C	F	K	Y	I	T	S	Q	F	E	V	R	.	.	.	.	.	.	.	F	S	A	T	I	Y	L	V	C	F	C	F	F	K	Q	L	A	M	I	F	M	S	V	L	A	G	N	M	Y	E	S	I	G	F	Q	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																																S		G	G	.	.	.	.	.	.	.	G										T	T	T																							.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.								.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	S	T	Q	A	L	L	G	M	Q	F	I	M	I	A	L	P	T	L	F	F	M	V	T	L	I	L	Y	F	R	F	Y	R	L	N	G	D	T	L	R	R	I	Q	I	H	L	L	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	Y	L	V	L	G	L	V	A	L	G	F	T	L	I	S	V	F	T	L	S	G	P	G	P	L	S	L	L	R	R	Q	V	N	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					S			S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.