Job Description P0C7L2 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:30:04 GMT 2012 Rank 56 Aligned Residues 292 % Identity 23% Template c2uv8C_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:fatty acid synthase subunit alpha (fas2); PDBTitle: crystal structure of yeast fatty acid synthase with stalled2 acyl carrier protein at 3.1 angstrom resolution Resolution 3.10 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.										.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.						.	.	.	.	50					.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.						.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.						.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	R	T	P	I	G	R	Y	G	G	A	L	S	S	V	R	A	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	A	I	P	L	R	E	L	L	V	R	N	P	R	L	D	.	.	.	.	.	A	E	C	I	D	.	.	.	.	D	V	I	L	G	C	A	N	Q	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.						.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.													.	.	.	.	.	.	.	.	.												.						.	.	.	.	.						.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.																																	.
Template Sequence		A	G	Q	I	P	T	G	.	W	N	A	K	T	Y	G	I	S	D	D	I	I	S	Q	V	D	P	I	T	L	F	V	L	V	S	V	V	E	A	F	I	.	A	S	G	I	T	D	P	Y	E	M	Y	K	Y	V	H	V	S	E	V	G	N	C	S	G	S	G	M	G	G	V	S	A	L	R	G	M	F	K	D
Template Known Secondary structure							T	T	.			T	T	T	T	T									S																	.		T	T			S	G	G	G					S		G	G	G								S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure									.																																	.
Template SS confidence
		1186	.	.	.	1190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.
																62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.		.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	N	R	N	V	A	R	M	A	T	.	L	L	A	G	L	P	Q	S	V	S	G	T	T	I	N	R	L	C	G	S	G	L	D	A	L	G	F	A	A	R	A	I	K	A	G	D	G	D	L	L	I	A	G	G	V	E	S	M	S	R	A	P	F	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.						.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	F	K	D	E	P	V	Q	N	D	I	L	Q	E	S	F	I	N	T	M	S	A	W	V	N	M	L	L	I	S	S	.	.	S	G	P	I	K	T	P	V	G	A	C	A	T	S	V	E	S	V	D	I	G	V	E	T	I	L	S	G	K	A	R	I	C	I	V	G	G	Y	D	D	F	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T					T	T						S	T	T										T	T			.	.		S								G	G	G															T	T	S		S											.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1264	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.			.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	K	A	A	S	A	F	S	R	Q	A	E	M	F	D	T	T	I	G	W	R	F	V	N	P	L	M	A	Q	Q	F	G	T	D	S	M	P	E	T	A	E	N	V	A	E	L	L	K	I	S	R	E	D	Q	D	S	F	A	L	R	S	Q	Q	R	T	A	K	A	Q	S	S	G	I	L	A	E	E	I	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	E	G	S	F	E	F	G	N	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																				1336	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	V	V	L	K	N	K	K	G	V	V	T	E	I	Q	H	D	E	H	L	R	P	E	T	T	L	E	Q	L	R	G	L	K	A	P	F	R	A	N	G	V	I	T	A	G	N	A	S	G	V	N	D	G	A	A	A	L	I	I	A	S	E	Q	M	A	A	A	Q	G	L	T	P	R	A	R	I	V	A	M	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	T	S	N	T	L	E	E	F	E	H	G	R	T	P	A	E	M	S	R	P	A	T	T	T	R	N	G	F	M	E	A	Q	G	A	G	I	Q	I	I	M	Q	A	D	L	A	L	K	M	G	V	P	I	Y	G	I	V	A	M	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		B									T	T			G	G	G	S			T	T	B	T	T			S	B		B	B																		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				1347	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	G	V	E	P	R	L	M	G	L	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	T	D	K	I	G	R	S	V	P	A	P	G	K	G	I	L	T	T	A	R	E	H	H	S	S	V	K	Y	A	S	P	N	L	N	M	K	Y	R	K	R	Q	L	V	T	R	E	A	Q	I	K	D	W	V	E	N	E	L	E	A	L	K	L	E	A	E	E	I	P	S	E	D	Q	N	E	F	L	L	E
Template Known Secondary structure							S		S		T	T				S	G	G	G	G	G	G					S			S	S			G	G	G																																T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1409	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.
																																300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.									.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	A	T	R	R	V	L	E	R	A	G	L	S	I	H	D	M	D	V	I	E	L	N	E	A	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	A	L	G	V	L	R	E	L	G	L	P	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		R	T	R	E	I	H	N	E	A	E	S	Q	L	R	A	A	Q	Q	Q	W	G	N	D	F	Y	K	R	D	P	R	I	A	P	L	R	G	A	L	A	T	Y	G	L	T	I	D	D	L	G	V	A	S	F	H	G	T	S	T	K	A	N	D	K	N	E	S	A	T	I	N	E	M	M	K	H	L	G	R	S	.
Template Known Secondary structure																						T	T	S	T	T	T	T		S	S	S									T	T	T			G	G	G										S																				T			.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		1489	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	P	H	V	N	P	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	L	G	M	S	G	A	R	L	A	L	A	A	S	H	E	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	N	G	R	Y	A	L	C	T	M	C	I	G
Query Conservation															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.
Template Sequence		E	G	N	P	V	.	I	G	V	F	Q	K	F	L	T	G	H	P	K	G	A	A	G	A	W	M	M	N	G	A	L	Q	I	L	N	S	G	I	I	P	G	N	R	N	A	D	N	V	D	K	I	L	E	Q	F	E	Y	V	L	Y	P	S	K	T	L	K	T	D	G	V	R	A	V	S	I	T	S	F	G	F
Template Known Secondary structure		T	T				.					T						B		G	G	G														T	T							T	T		S	S	B		G	G	G	G	G		T	T					S	S					S												T
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		1568	.	1570	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	Q	G	I	A	M	I	L	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	K	G	G	Q	A	I	V	V
Template Known Secondary structure		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1647	.	.	1650	.	.	.	.	.	.